Protein–RNA interactions for Protein: P13609

Srgn, Serglycin, mousemouse

Predictions only

Length 152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrgnP13609 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SrgnP13609 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SrgnP13609 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
SrgnP13609 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SrgnP13609 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SrgnP13609 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SrgnP13609 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SrgnP13609 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SrgnP13609 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SrgnP13609 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SrgnP13609 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SrgnP13609 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SrgnP13609 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SrgnP13609 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SrgnP13609 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SrgnP13609 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SrgnP13609 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SrgnP13609 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SrgnP13609 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SrgnP13609 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SrgnP13609 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SrgnP13609 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SrgnP13609 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SrgnP13609 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SrgnP13609 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SrgnP13609 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SrgnP13609 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SrgnP13609 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SrgnP13609 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SrgnP13609 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SrgnP13609 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SrgnP13609 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SrgnP13609 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SrgnP13609 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SrgnP13609 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SrgnP13609 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SrgnP13609 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SrgnP13609 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SrgnP13609 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SrgnP13609 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
SrgnP13609 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SrgnP13609 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SrgnP13609 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SrgnP13609 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SrgnP13609 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
SrgnP13609 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SrgnP13609 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SrgnP13609 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SrgnP13609 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SrgnP13609 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SrgnP13609 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SrgnP13609 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SrgnP13609 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SrgnP13609 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SrgnP13609 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SrgnP13609 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SrgnP13609 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SrgnP13609 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
SrgnP13609 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
SrgnP13609 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
SrgnP13609 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
SrgnP13609 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.06
SrgnP13609 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
SrgnP13609 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
SrgnP13609 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SrgnP13609 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SrgnP13609 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SrgnP13609 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SrgnP13609 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SrgnP13609 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SrgnP13609 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SrgnP13609 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SrgnP13609 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SrgnP13609 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
SrgnP13609 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SrgnP13609 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SrgnP13609 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SrgnP13609 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
SrgnP13609 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
SrgnP13609 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SrgnP13609 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
SrgnP13609 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SrgnP13609 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SrgnP13609 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SrgnP13609 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SrgnP13609 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SrgnP13609 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SrgnP13609 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SrgnP13609 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SrgnP13609 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SrgnP13609 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SrgnP13609 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SrgnP13609 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SrgnP13609 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SrgnP13609 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SrgnP13609 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SrgnP13609 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SrgnP13609 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SrgnP13609 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SrgnP13609 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms