Protein–RNA interactions for Protein: P13372

Vpreb1, Immunoglobulin iota chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb1P13372 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Vpreb1P13372 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Vpreb1P13372 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Vpreb1P13372 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Vpreb1P13372 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
Vpreb1P13372 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Vpreb1P13372 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Vpreb1P13372 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Vpreb1P13372 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Vpreb1P13372 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Vpreb1P13372 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Vpreb1P13372 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Vpreb1P13372 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Vpreb1P13372 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Vpreb1P13372 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Vpreb1P13372 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Vpreb1P13372 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Vpreb1P13372 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Vpreb1P13372 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Vpreb1P13372 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Vpreb1P13372 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Vpreb1P13372 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Vpreb1P13372 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Vpreb1P13372 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Vpreb1P13372 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Vpreb1P13372 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Vpreb1P13372 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
Vpreb1P13372 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Vpreb1P13372 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Vpreb1P13372 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Vpreb1P13372 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Vpreb1P13372 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Vpreb1P13372 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Vpreb1P13372 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Vpreb1P13372 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Vpreb1P13372 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Vpreb1P13372 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Vpreb1P13372 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Vpreb1P13372 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Vpreb1P13372 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Vpreb1P13372 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Vpreb1P13372 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Vpreb1P13372 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Vpreb1P13372 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Vpreb1P13372 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
Vpreb1P13372 Grm5-201ENSMUST00000107263 3516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Vpreb1P13372 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Vpreb1P13372 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
Vpreb1P13372 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Vpreb1P13372 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
Vpreb1P13372 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
Vpreb1P13372 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
Vpreb1P13372 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Vpreb1P13372 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
Vpreb1P13372 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Vpreb1P13372 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Vpreb1P13372 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Vpreb1P13372 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
Vpreb1P13372 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
Vpreb1P13372 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
Vpreb1P13372 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
Vpreb1P13372 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
Vpreb1P13372 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
Vpreb1P13372 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
Vpreb1P13372 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
Vpreb1P13372 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
Vpreb1P13372 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
Vpreb1P13372 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Vpreb1P13372 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Vpreb1P13372 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Vpreb1P13372 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Vpreb1P13372 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
Vpreb1P13372 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
Vpreb1P13372 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Vpreb1P13372 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Vpreb1P13372 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Vpreb1P13372 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Vpreb1P13372 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Vpreb1P13372 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Vpreb1P13372 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Vpreb1P13372 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Vpreb1P13372 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Vpreb1P13372 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Vpreb1P13372 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Vpreb1P13372 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Vpreb1P13372 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Vpreb1P13372 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Vpreb1P13372 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Vpreb1P13372 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Vpreb1P13372 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Vpreb1P13372 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Vpreb1P13372 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Vpreb1P13372 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Vpreb1P13372 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Vpreb1P13372 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Vpreb1P13372 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Vpreb1P13372 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Vpreb1P13372 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Vpreb1P13372 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Vpreb1P13372 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms