Protein–RNA interactions for Protein: P11416

Rara, Retinoic acid receptor alpha, mousemouse

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Length 462 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RaraP11416 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RaraP11416 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RaraP11416 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RaraP11416 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RaraP11416 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RaraP11416 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RaraP11416 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RaraP11416 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RaraP11416 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RaraP11416 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RaraP11416 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RaraP11416 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RaraP11416 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RaraP11416 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RaraP11416 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RaraP11416 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RaraP11416 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RaraP11416 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RaraP11416 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RaraP11416 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RaraP11416 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RaraP11416 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RaraP11416 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RaraP11416 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RaraP11416 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RaraP11416 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RaraP11416 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RaraP11416 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RaraP11416 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RaraP11416 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RaraP11416 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RaraP11416 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RaraP11416 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RaraP11416 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RaraP11416 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RaraP11416 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RaraP11416 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RaraP11416 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RaraP11416 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RaraP11416 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RaraP11416 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RaraP11416 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RaraP11416 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RaraP11416 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RaraP11416 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RaraP11416 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RaraP11416 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RaraP11416 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RaraP11416 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RaraP11416 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RaraP11416 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RaraP11416 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RaraP11416 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RaraP11416 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RaraP11416 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RaraP11416 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RaraP11416 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RaraP11416 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RaraP11416 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RaraP11416 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RaraP11416 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RaraP11416 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RaraP11416 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RaraP11416 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RaraP11416 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
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RaraP11416 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
RaraP11416 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
RaraP11416 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RaraP11416 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RaraP11416 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RaraP11416 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RaraP11416 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RaraP11416 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RaraP11416 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RaraP11416 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RaraP11416 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RaraP11416 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RaraP11416 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RaraP11416 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RaraP11416 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RaraP11416 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RaraP11416 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RaraP11416 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RaraP11416 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RaraP11416 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RaraP11416 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RaraP11416 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RaraP11416 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RaraP11416 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RaraP11416 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RaraP11416 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RaraP11416 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RaraP11416 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RaraP11416 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RaraP11416 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RaraP11416 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RaraP11416 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RaraP11416 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RaraP11416 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
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