Protein–RNA interactions for Protein: P11403

Fgf4, Fibroblast growth factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgf4P11403 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Fgf4P11403 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Fgf4P11403 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Fgf4P11403 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Fgf4P11403 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Fgf4P11403 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Fgf4P11403 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Fgf4P11403 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Fgf4P11403 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Fgf4P11403 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Fgf4P11403 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Fgf4P11403 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Fgf4P11403 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Fgf4P11403 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Fgf4P11403 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Fgf4P11403 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Fgf4P11403 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Fgf4P11403 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Fgf4P11403 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Fgf4P11403 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Fgf4P11403 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Fgf4P11403 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Fgf4P11403 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Fgf4P11403 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Fgf4P11403 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Fgf4P11403 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Fgf4P11403 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Fgf4P11403 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Fgf4P11403 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Fgf4P11403 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Fgf4P11403 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Fgf4P11403 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Fgf4P11403 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Fgf4P11403 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Fgf4P11403 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Fgf4P11403 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Fgf4P11403 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Fgf4P11403 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Fgf4P11403 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Fgf4P11403 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Fgf4P11403 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Fgf4P11403 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Fgf4P11403 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Fgf4P11403 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Fgf4P11403 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Fgf4P11403 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Fgf4P11403 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Fgf4P11403 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Fgf4P11403 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Fgf4P11403 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Fgf4P11403 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Fgf4P11403 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Fgf4P11403 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Fgf4P11403 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Fgf4P11403 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Fgf4P11403 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Fgf4P11403 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Fgf4P11403 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Fgf4P11403 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Fgf4P11403 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Fgf4P11403 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Fgf4P11403 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Fgf4P11403 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Fgf4P11403 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Fgf4P11403 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Fgf4P11403 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Fgf4P11403 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Fgf4P11403 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Fgf4P11403 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Fgf4P11403 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Fgf4P11403 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Fgf4P11403 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Fgf4P11403 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Fgf4P11403 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Fgf4P11403 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Fgf4P11403 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Fgf4P11403 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Fgf4P11403 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Fgf4P11403 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Fgf4P11403 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Fgf4P11403 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Fgf4P11403 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Fgf4P11403 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Fgf4P11403 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Fgf4P11403 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Fgf4P11403 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Fgf4P11403 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Fgf4P11403 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Fgf4P11403 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Fgf4P11403 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Fgf4P11403 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Fgf4P11403 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Fgf4P11403 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Fgf4P11403 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Fgf4P11403 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Fgf4P11403 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Fgf4P11403 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Fgf4P11403 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Fgf4P11403 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Fgf4P11403 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.4 ms