Protein–RNA interactions for Protein: P10148

Ccl2, C-C motif chemokine 2, mousemouse

Predictions only

Length 148 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl2P10148 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ccl2P10148 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ccl2P10148 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ccl2P10148 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ccl2P10148 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ccl2P10148 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ccl2P10148 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ccl2P10148 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ccl2P10148 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ccl2P10148 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ccl2P10148 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ccl2P10148 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ccl2P10148 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ccl2P10148 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ccl2P10148 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ccl2P10148 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ccl2P10148 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ccl2P10148 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Ccl2P10148 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ccl2P10148 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ccl2P10148 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ccl2P10148 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ccl2P10148 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Ccl2P10148 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Ccl2P10148 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Ccl2P10148 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ccl2P10148 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ccl2P10148 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ccl2P10148 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ccl2P10148 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ccl2P10148 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ccl2P10148 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Ccl2P10148 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ccl2P10148 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ccl2P10148 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ccl2P10148 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ccl2P10148 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ccl2P10148 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ccl2P10148 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ccl2P10148 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ccl2P10148 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ccl2P10148 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ccl2P10148 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ccl2P10148 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ccl2P10148 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ccl2P10148 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ccl2P10148 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ccl2P10148 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ccl2P10148 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Ccl2P10148 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ccl2P10148 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ccl2P10148 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ccl2P10148 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ccl2P10148 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ccl2P10148 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ccl2P10148 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ccl2P10148 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ccl2P10148 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ccl2P10148 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ccl2P10148 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ccl2P10148 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ccl2P10148 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ccl2P10148 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ccl2P10148 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Ccl2P10148 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Ccl2P10148 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ccl2P10148 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ccl2P10148 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ccl2P10148 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ccl2P10148 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Ccl2P10148 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ccl2P10148 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ccl2P10148 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ccl2P10148 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ccl2P10148 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Ccl2P10148 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ccl2P10148 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Ccl2P10148 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ccl2P10148 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ccl2P10148 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ccl2P10148 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ccl2P10148 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ccl2P10148 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ccl2P10148 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ccl2P10148 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ccl2P10148 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ccl2P10148 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ccl2P10148 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ccl2P10148 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ccl2P10148 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ccl2P10148 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ccl2P10148 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ccl2P10148 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ccl2P10148 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ccl2P10148 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ccl2P10148 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ccl2P10148 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ccl2P10148 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ccl2P10148 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ccl2P10148 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52 ms