Protein–RNA interactions for Protein: P0DP43

Catspere, Cation channel sperm-associated protein subunit epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CatspereP0DP43 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CatspereP0DP43 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CatspereP0DP43 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CatspereP0DP43 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CatspereP0DP43 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CatspereP0DP43 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CatspereP0DP43 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CatspereP0DP43 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CatspereP0DP43 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CatspereP0DP43 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CatspereP0DP43 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CatspereP0DP43 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CatspereP0DP43 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CatspereP0DP43 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CatspereP0DP43 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CatspereP0DP43 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CatspereP0DP43 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CatspereP0DP43 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CatspereP0DP43 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CatspereP0DP43 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CatspereP0DP43 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CatspereP0DP43 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CatspereP0DP43 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CatspereP0DP43 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CatspereP0DP43 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CatspereP0DP43 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CatspereP0DP43 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CatspereP0DP43 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CatspereP0DP43 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CatspereP0DP43 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CatspereP0DP43 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CatspereP0DP43 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CatspereP0DP43 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CatspereP0DP43 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CatspereP0DP43 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CatspereP0DP43 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CatspereP0DP43 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CatspereP0DP43 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CatspereP0DP43 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CatspereP0DP43 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CatspereP0DP43 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
CatspereP0DP43 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CatspereP0DP43 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CatspereP0DP43 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CatspereP0DP43 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CatspereP0DP43 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CatspereP0DP43 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CatspereP0DP43 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CatspereP0DP43 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CatspereP0DP43 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CatspereP0DP43 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CatspereP0DP43 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CatspereP0DP43 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CatspereP0DP43 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CatspereP0DP43 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CatspereP0DP43 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CatspereP0DP43 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CatspereP0DP43 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CatspereP0DP43 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CatspereP0DP43 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CatspereP0DP43 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CatspereP0DP43 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CatspereP0DP43 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CatspereP0DP43 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CatspereP0DP43 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CatspereP0DP43 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CatspereP0DP43 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CatspereP0DP43 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CatspereP0DP43 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CatspereP0DP43 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CatspereP0DP43 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
CatspereP0DP43 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
CatspereP0DP43 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
CatspereP0DP43 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CatspereP0DP43 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CatspereP0DP43 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CatspereP0DP43 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
CatspereP0DP43 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CatspereP0DP43 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CatspereP0DP43 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CatspereP0DP43 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CatspereP0DP43 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CatspereP0DP43 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CatspereP0DP43 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CatspereP0DP43 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CatspereP0DP43 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CatspereP0DP43 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CatspereP0DP43 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CatspereP0DP43 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CatspereP0DP43 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CatspereP0DP43 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CatspereP0DP43 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
CatspereP0DP43 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CatspereP0DP43 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CatspereP0DP43 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CatspereP0DP43 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CatspereP0DP43 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CatspereP0DP43 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CatspereP0DP43 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CatspereP0DP43 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms