Protein–RNA interactions for Protein: P04202

Tgfb1, Transforming growth factor beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgfb1P04202 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tgfb1P04202 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Tgfb1P04202 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tgfb1P04202 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tgfb1P04202 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tgfb1P04202 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tgfb1P04202 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tgfb1P04202 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tgfb1P04202 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tgfb1P04202 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tgfb1P04202 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tgfb1P04202 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tgfb1P04202 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tgfb1P04202 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tgfb1P04202 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tgfb1P04202 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tgfb1P04202 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Tgfb1P04202 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tgfb1P04202 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tgfb1P04202 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tgfb1P04202 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tgfb1P04202 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tgfb1P04202 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tgfb1P04202 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tgfb1P04202 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tgfb1P04202 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tgfb1P04202 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tgfb1P04202 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tgfb1P04202 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tgfb1P04202 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tgfb1P04202 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tgfb1P04202 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tgfb1P04202 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tgfb1P04202 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tgfb1P04202 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tgfb1P04202 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tgfb1P04202 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tgfb1P04202 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Tgfb1P04202 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Tgfb1P04202 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tgfb1P04202 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tgfb1P04202 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tgfb1P04202 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Tgfb1P04202 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tgfb1P04202 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tgfb1P04202 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tgfb1P04202 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tgfb1P04202 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tgfb1P04202 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tgfb1P04202 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tgfb1P04202 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tgfb1P04202 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tgfb1P04202 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tgfb1P04202 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Tgfb1P04202 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tgfb1P04202 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tgfb1P04202 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tgfb1P04202 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tgfb1P04202 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tgfb1P04202 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tgfb1P04202 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tgfb1P04202 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tgfb1P04202 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tgfb1P04202 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tgfb1P04202 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tgfb1P04202 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tgfb1P04202 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tgfb1P04202 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Tgfb1P04202 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tgfb1P04202 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tgfb1P04202 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tgfb1P04202 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tgfb1P04202 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tgfb1P04202 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tgfb1P04202 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tgfb1P04202 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tgfb1P04202 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tgfb1P04202 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tgfb1P04202 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tgfb1P04202 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tgfb1P04202 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tgfb1P04202 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tgfb1P04202 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tgfb1P04202 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tgfb1P04202 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tgfb1P04202 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tgfb1P04202 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tgfb1P04202 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tgfb1P04202 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tgfb1P04202 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tgfb1P04202 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tgfb1P04202 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Tgfb1P04202 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tgfb1P04202 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tgfb1P04202 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tgfb1P04202 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tgfb1P04202 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Tgfb1P04202 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Tgfb1P04202 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tgfb1P04202 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms