Protein–RNA interactions for Protein: P01791

Ig heavy chain V region HPCM6, mousemouse

Predictions only

Length 123 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01791 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
P01791 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
P01791 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01791 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01791 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01791 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01791 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01791 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01791 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01791 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01791 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01791 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01791 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
P01791 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01791 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01791 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01791 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01791 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01791 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01791 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
P01791 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01791 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01791 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01791 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01791 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01791 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01791 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01791 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01791 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01791 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01791 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01791 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
P01791 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01791 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01791 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01791 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01791 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01791 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01791 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01791 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01791 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01791 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01791 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01791 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01791 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01791 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01791 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01791 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01791 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
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P01791 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
P01791 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01791 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01791 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01791 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01791 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01791 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01791 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
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P01791 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01791 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01791 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
P01791 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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P01791 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01791 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01791 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
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P01791 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01791 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01791 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01791 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01791 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01791 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01791 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01791 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01791 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01791 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01791 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01791 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01791 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01791 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01791 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01791 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01791 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01791 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
P01791 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01791 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01791 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01791 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01791 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01791 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01791 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
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P01791 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01791 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01791 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01791 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01791 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
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