Protein–RNA interactions for Protein: P01575

Ifnb1, Interferon beta, mousemouse

Predictions only

Length 182 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifnb1P01575 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ifnb1P01575 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Ifnb1P01575 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ifnb1P01575 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ifnb1P01575 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ifnb1P01575 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ifnb1P01575 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ifnb1P01575 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ifnb1P01575 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ifnb1P01575 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ifnb1P01575 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ifnb1P01575 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ifnb1P01575 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ifnb1P01575 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ifnb1P01575 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ifnb1P01575 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ifnb1P01575 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ifnb1P01575 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ifnb1P01575 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ifnb1P01575 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ifnb1P01575 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ifnb1P01575 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ifnb1P01575 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ifnb1P01575 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ifnb1P01575 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ifnb1P01575 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ifnb1P01575 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Ifnb1P01575 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Ifnb1P01575 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ifnb1P01575 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ifnb1P01575 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ifnb1P01575 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ifnb1P01575 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ifnb1P01575 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Ifnb1P01575 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ifnb1P01575 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ifnb1P01575 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ifnb1P01575 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ifnb1P01575 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ifnb1P01575 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ifnb1P01575 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ifnb1P01575 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ifnb1P01575 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ifnb1P01575 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ifnb1P01575 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ifnb1P01575 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ifnb1P01575 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ifnb1P01575 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ifnb1P01575 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ifnb1P01575 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ifnb1P01575 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ifnb1P01575 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ifnb1P01575 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ifnb1P01575 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ifnb1P01575 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ifnb1P01575 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ifnb1P01575 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Ifnb1P01575 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ifnb1P01575 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ifnb1P01575 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ifnb1P01575 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ifnb1P01575 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ifnb1P01575 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ifnb1P01575 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ifnb1P01575 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ifnb1P01575 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ifnb1P01575 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ifnb1P01575 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ifnb1P01575 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ifnb1P01575 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ifnb1P01575 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ifnb1P01575 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ifnb1P01575 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ifnb1P01575 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Ifnb1P01575 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ifnb1P01575 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ifnb1P01575 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ifnb1P01575 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ifnb1P01575 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ifnb1P01575 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ifnb1P01575 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ifnb1P01575 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ifnb1P01575 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ifnb1P01575 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ifnb1P01575 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Ifnb1P01575 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ifnb1P01575 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ifnb1P01575 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ifnb1P01575 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Ifnb1P01575 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ifnb1P01575 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ifnb1P01575 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ifnb1P01575 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ifnb1P01575 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ifnb1P01575 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ifnb1P01575 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ifnb1P01575 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ifnb1P01575 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ifnb1P01575 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ifnb1P01575 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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