Protein–RNA interactions for Protein: O88255

Gm10509, Mszf57 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 85 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm10509O88255 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm10509O88255 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm10509O88255 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm10509O88255 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm10509O88255 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm10509O88255 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm10509O88255 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm10509O88255 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm10509O88255 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm10509O88255 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm10509O88255 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm10509O88255 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm10509O88255 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm10509O88255 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm10509O88255 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm10509O88255 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm10509O88255 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm10509O88255 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm10509O88255 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm10509O88255 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm10509O88255 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm10509O88255 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm10509O88255 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm10509O88255 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm10509O88255 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm10509O88255 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm10509O88255 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm10509O88255 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm10509O88255 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm10509O88255 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm10509O88255 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm10509O88255 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm10509O88255 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm10509O88255 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm10509O88255 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm10509O88255 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm10509O88255 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm10509O88255 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm10509O88255 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm10509O88255 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm10509O88255 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm10509O88255 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm10509O88255 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm10509O88255 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm10509O88255 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm10509O88255 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm10509O88255 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm10509O88255 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm10509O88255 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm10509O88255 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm10509O88255 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm10509O88255 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm10509O88255 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm10509O88255 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm10509O88255 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm10509O88255 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm10509O88255 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm10509O88255 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm10509O88255 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm10509O88255 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm10509O88255 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm10509O88255 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm10509O88255 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm10509O88255 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm10509O88255 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm10509O88255 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm10509O88255 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm10509O88255 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm10509O88255 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm10509O88255 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm10509O88255 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm10509O88255 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm10509O88255 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm10509O88255 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm10509O88255 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm10509O88255 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm10509O88255 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm10509O88255 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm10509O88255 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm10509O88255 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm10509O88255 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm10509O88255 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm10509O88255 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm10509O88255 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm10509O88255 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm10509O88255 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm10509O88255 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm10509O88255 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm10509O88255 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm10509O88255 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm10509O88255 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm10509O88255 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm10509O88255 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm10509O88255 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm10509O88255 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm10509O88255 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm10509O88255 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm10509O88255 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm10509O88255 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm10509O88255 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.3 ms