Protein–RNA interactions for Protein: O70491

Stra6, Receptor for retinol uptake STRA6, mousemouse

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Length 670 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stra6O70491 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Stra6O70491 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Stra6O70491 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Stra6O70491 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Stra6O70491 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Stra6O70491 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Stra6O70491 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Stra6O70491 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Stra6O70491 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Stra6O70491 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Stra6O70491 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Stra6O70491 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Stra6O70491 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Stra6O70491 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Stra6O70491 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Stra6O70491 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Stra6O70491 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Stra6O70491 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Stra6O70491 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Stra6O70491 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Stra6O70491 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Stra6O70491 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Stra6O70491 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Stra6O70491 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Stra6O70491 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Stra6O70491 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Stra6O70491 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Stra6O70491 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Stra6O70491 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Stra6O70491 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Stra6O70491 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Stra6O70491 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Stra6O70491 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Stra6O70491 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Stra6O70491 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Stra6O70491 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Stra6O70491 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Stra6O70491 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Stra6O70491 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Stra6O70491 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Stra6O70491 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Stra6O70491 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Stra6O70491 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Stra6O70491 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Stra6O70491 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Stra6O70491 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Stra6O70491 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Stra6O70491 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Stra6O70491 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Stra6O70491 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Stra6O70491 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Stra6O70491 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Stra6O70491 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Stra6O70491 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Stra6O70491 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Stra6O70491 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Stra6O70491 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Stra6O70491 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Stra6O70491 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Stra6O70491 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Stra6O70491 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Stra6O70491 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Stra6O70491 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Stra6O70491 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Stra6O70491 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Stra6O70491 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Stra6O70491 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Stra6O70491 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Stra6O70491 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Stra6O70491 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Stra6O70491 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Stra6O70491 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Stra6O70491 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Stra6O70491 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Stra6O70491 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Stra6O70491 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Stra6O70491 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Stra6O70491 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Stra6O70491 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Stra6O70491 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Stra6O70491 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Stra6O70491 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Stra6O70491 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Stra6O70491 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Stra6O70491 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Stra6O70491 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Stra6O70491 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Stra6O70491 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Stra6O70491 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Stra6O70491 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Stra6O70491 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Stra6O70491 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Stra6O70491 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Stra6O70491 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Stra6O70491 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Stra6O70491 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Stra6O70491 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Stra6O70491 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Stra6O70491 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Stra6O70491 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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