Protein–RNA interactions for Protein: O70404

Vamp8, Vesicle-associated membrane protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp8O70404 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Vamp8O70404 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Vamp8O70404 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Vamp8O70404 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Vamp8O70404 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Vamp8O70404 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Vamp8O70404 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Vamp8O70404 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Vamp8O70404 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Vamp8O70404 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Vamp8O70404 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Vamp8O70404 Myo18a-210ENSMUST00000130305 5450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vamp8O70404 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vamp8O70404 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vamp8O70404 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vamp8O70404 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vamp8O70404 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vamp8O70404 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vamp8O70404 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vamp8O70404 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vamp8O70404 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vamp8O70404 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vamp8O70404 Prrc2b-202ENSMUST00000069817 10671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vamp8O70404 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Vamp8O70404 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vamp8O70404 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vamp8O70404 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vamp8O70404 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vamp8O70404 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Vamp8O70404 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vamp8O70404 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vamp8O70404 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vamp8O70404 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vamp8O70404 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Vamp8O70404 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vamp8O70404 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vamp8O70404 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vamp8O70404 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vamp8O70404 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vamp8O70404 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vamp8O70404 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vamp8O70404 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vamp8O70404 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vamp8O70404 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vamp8O70404 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vamp8O70404 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vamp8O70404 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vamp8O70404 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vamp8O70404 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vamp8O70404 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vamp8O70404 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vamp8O70404 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vamp8O70404 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vamp8O70404 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vamp8O70404 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vamp8O70404 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Vamp8O70404 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vamp8O70404 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vamp8O70404 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vamp8O70404 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vamp8O70404 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vamp8O70404 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vamp8O70404 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vamp8O70404 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vamp8O70404 Itgb4-204ENSMUST00000106460 5919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vamp8O70404 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vamp8O70404 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vamp8O70404 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vamp8O70404 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vamp8O70404 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vamp8O70404 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vamp8O70404 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vamp8O70404 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Vamp8O70404 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vamp8O70404 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vamp8O70404 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vamp8O70404 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vamp8O70404 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Vamp8O70404 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vamp8O70404 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vamp8O70404 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vamp8O70404 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vamp8O70404 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vamp8O70404 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vamp8O70404 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vamp8O70404 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vamp8O70404 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vamp8O70404 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vamp8O70404 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vamp8O70404 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vamp8O70404 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vamp8O70404 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vamp8O70404 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vamp8O70404 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vamp8O70404 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vamp8O70404 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vamp8O70404 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vamp8O70404 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vamp8O70404 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vamp8O70404 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.3 ms