Protein–RNA interactions for Protein: O54965

Rnf13, E3 ubiquitin-protein ligase RNF13, mousemouse

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Length 381 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf13O54965 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf13O54965 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf13O54965 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf13O54965 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf13O54965 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf13O54965 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf13O54965 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf13O54965 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf13O54965 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf13O54965 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf13O54965 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf13O54965 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Rnf13O54965 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Rnf13O54965 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Rnf13O54965 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf13O54965 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf13O54965 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf13O54965 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf13O54965 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf13O54965 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf13O54965 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Rnf13O54965 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf13O54965 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf13O54965 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf13O54965 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Rnf13O54965 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf13O54965 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf13O54965 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rnf13O54965 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Rnf13O54965 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Rnf13O54965 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rnf13O54965 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Rnf13O54965 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rnf13O54965 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Rnf13O54965 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rnf13O54965 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rnf13O54965 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
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Rnf13O54965 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rnf13O54965 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rnf13O54965 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rnf13O54965 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rnf13O54965 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rnf13O54965 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rnf13O54965 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Rnf13O54965 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rnf13O54965 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rnf13O54965 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rnf13O54965 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rnf13O54965 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rnf13O54965 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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