Protein–RNA interactions for Protein: O54786

Dffa, DNA fragmentation factor subunit alpha, mousemouse

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DffaO54786 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DffaO54786 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DffaO54786 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
DffaO54786 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DffaO54786 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DffaO54786 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
DffaO54786 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DffaO54786 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DffaO54786 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DffaO54786 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DffaO54786 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DffaO54786 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DffaO54786 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
DffaO54786 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DffaO54786 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
DffaO54786 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DffaO54786 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DffaO54786 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
DffaO54786 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
DffaO54786 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DffaO54786 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DffaO54786 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
DffaO54786 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
DffaO54786 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DffaO54786 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
DffaO54786 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
DffaO54786 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DffaO54786 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
DffaO54786 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DffaO54786 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DffaO54786 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
DffaO54786 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
DffaO54786 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
DffaO54786 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
DffaO54786 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DffaO54786 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
DffaO54786 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
DffaO54786 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DffaO54786 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
DffaO54786 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
DffaO54786 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DffaO54786 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DffaO54786 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DffaO54786 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DffaO54786 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DffaO54786 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
DffaO54786 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DffaO54786 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DffaO54786 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DffaO54786 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DffaO54786 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DffaO54786 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DffaO54786 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DffaO54786 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DffaO54786 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DffaO54786 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DffaO54786 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DffaO54786 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DffaO54786 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DffaO54786 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DffaO54786 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DffaO54786 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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DffaO54786 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DffaO54786 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DffaO54786 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
DffaO54786 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DffaO54786 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DffaO54786 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DffaO54786 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DffaO54786 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DffaO54786 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DffaO54786 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DffaO54786 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DffaO54786 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DffaO54786 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DffaO54786 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
DffaO54786 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DffaO54786 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DffaO54786 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DffaO54786 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DffaO54786 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DffaO54786 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DffaO54786 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DffaO54786 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DffaO54786 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DffaO54786 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DffaO54786 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DffaO54786 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DffaO54786 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DffaO54786 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DffaO54786 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DffaO54786 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms