Protein–RNA interactions for Protein: O35902

Dsg3, Desmoglein-3, mousemouse

Predictions only

Length 993 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg3O35902 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dsg3O35902 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dsg3O35902 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dsg3O35902 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dsg3O35902 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dsg3O35902 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dsg3O35902 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dsg3O35902 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dsg3O35902 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dsg3O35902 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dsg3O35902 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dsg3O35902 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dsg3O35902 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dsg3O35902 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dsg3O35902 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dsg3O35902 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dsg3O35902 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dsg3O35902 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dsg3O35902 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dsg3O35902 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dsg3O35902 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dsg3O35902 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dsg3O35902 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Dsg3O35902 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dsg3O35902 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Dsg3O35902 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dsg3O35902 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dsg3O35902 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dsg3O35902 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dsg3O35902 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dsg3O35902 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dsg3O35902 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dsg3O35902 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dsg3O35902 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dsg3O35902 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dsg3O35902 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dsg3O35902 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dsg3O35902 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dsg3O35902 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dsg3O35902 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dsg3O35902 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dsg3O35902 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dsg3O35902 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dsg3O35902 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dsg3O35902 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dsg3O35902 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dsg3O35902 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dsg3O35902 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dsg3O35902 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dsg3O35902 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dsg3O35902 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dsg3O35902 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dsg3O35902 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dsg3O35902 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dsg3O35902 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dsg3O35902 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dsg3O35902 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dsg3O35902 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dsg3O35902 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dsg3O35902 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dsg3O35902 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dsg3O35902 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dsg3O35902 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dsg3O35902 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dsg3O35902 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dsg3O35902 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dsg3O35902 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dsg3O35902 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dsg3O35902 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dsg3O35902 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dsg3O35902 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dsg3O35902 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dsg3O35902 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dsg3O35902 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dsg3O35902 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dsg3O35902 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dsg3O35902 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dsg3O35902 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dsg3O35902 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dsg3O35902 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dsg3O35902 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dsg3O35902 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dsg3O35902 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dsg3O35902 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dsg3O35902 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dsg3O35902 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dsg3O35902 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dsg3O35902 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dsg3O35902 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dsg3O35902 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dsg3O35902 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dsg3O35902 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dsg3O35902 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dsg3O35902 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Dsg3O35902 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dsg3O35902 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dsg3O35902 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dsg3O35902 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dsg3O35902 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dsg3O35902 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms