Protein–RNA interactions for Protein: O19442

H2-M9, Histocompatibility 2, M region locus 9, mousemouse

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M9O19442 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
H2-M9O19442 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
H2-M9O19442 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
H2-M9O19442 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
H2-M9O19442 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
H2-M9O19442 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
H2-M9O19442 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
H2-M9O19442 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
H2-M9O19442 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
H2-M9O19442 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
H2-M9O19442 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
H2-M9O19442 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
H2-M9O19442 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
H2-M9O19442 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
H2-M9O19442 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
H2-M9O19442 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
H2-M9O19442 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
H2-M9O19442 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
H2-M9O19442 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
H2-M9O19442 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
H2-M9O19442 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
H2-M9O19442 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
H2-M9O19442 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
H2-M9O19442 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
H2-M9O19442 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
H2-M9O19442 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
H2-M9O19442 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
H2-M9O19442 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
H2-M9O19442 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
H2-M9O19442 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
H2-M9O19442 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
H2-M9O19442 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
H2-M9O19442 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
H2-M9O19442 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
H2-M9O19442 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
H2-M9O19442 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
H2-M9O19442 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
H2-M9O19442 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
H2-M9O19442 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
H2-M9O19442 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
H2-M9O19442 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
H2-M9O19442 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
H2-M9O19442 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
H2-M9O19442 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
H2-M9O19442 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
H2-M9O19442 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
H2-M9O19442 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
H2-M9O19442 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
H2-M9O19442 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
H2-M9O19442 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
H2-M9O19442 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
H2-M9O19442 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
H2-M9O19442 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
H2-M9O19442 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
H2-M9O19442 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
H2-M9O19442 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
H2-M9O19442 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
H2-M9O19442 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
H2-M9O19442 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
H2-M9O19442 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
H2-M9O19442 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
H2-M9O19442 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
H2-M9O19442 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
H2-M9O19442 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
H2-M9O19442 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
H2-M9O19442 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
H2-M9O19442 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
H2-M9O19442 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
H2-M9O19442 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
H2-M9O19442 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
H2-M9O19442 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
H2-M9O19442 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
H2-M9O19442 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
H2-M9O19442 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
H2-M9O19442 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
H2-M9O19442 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
H2-M9O19442 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
H2-M9O19442 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
H2-M9O19442 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
H2-M9O19442 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
H2-M9O19442 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
H2-M9O19442 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
H2-M9O19442 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
H2-M9O19442 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
H2-M9O19442 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
H2-M9O19442 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
H2-M9O19442 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
H2-M9O19442 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
H2-M9O19442 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
H2-M9O19442 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
H2-M9O19442 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
H2-M9O19442 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
H2-M9O19442 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
H2-M9O19442 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
H2-M9O19442 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
H2-M9O19442 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
H2-M9O19442 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
H2-M9O19442 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
H2-M9O19442 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
H2-M9O19442 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms