Protein–RNA interactions for Protein: O09165

Casq1, Calsequestrin-1, mousemouse

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Length 405 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casq1O09165 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Casq1O09165 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Casq1O09165 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Casq1O09165 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Casq1O09165 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Casq1O09165 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Casq1O09165 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Casq1O09165 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Casq1O09165 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Casq1O09165 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Casq1O09165 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Casq1O09165 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Casq1O09165 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Casq1O09165 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Casq1O09165 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Casq1O09165 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Casq1O09165 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Casq1O09165 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Casq1O09165 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Casq1O09165 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Casq1O09165 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Casq1O09165 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Casq1O09165 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Casq1O09165 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Casq1O09165 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Casq1O09165 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Casq1O09165 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Casq1O09165 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Casq1O09165 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Casq1O09165 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Casq1O09165 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Casq1O09165 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Casq1O09165 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Casq1O09165 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Casq1O09165 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Casq1O09165 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Casq1O09165 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Casq1O09165 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Casq1O09165 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Casq1O09165 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Casq1O09165 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Casq1O09165 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Casq1O09165 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Casq1O09165 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Casq1O09165 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Casq1O09165 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Casq1O09165 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Casq1O09165 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Casq1O09165 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Casq1O09165 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Casq1O09165 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Casq1O09165 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Casq1O09165 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Casq1O09165 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Casq1O09165 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Casq1O09165 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Casq1O09165 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Casq1O09165 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Casq1O09165 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Casq1O09165 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Casq1O09165 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Casq1O09165 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Casq1O09165 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Casq1O09165 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Casq1O09165 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Casq1O09165 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Casq1O09165 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Casq1O09165 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Casq1O09165 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Casq1O09165 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Casq1O09165 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Casq1O09165 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Casq1O09165 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Casq1O09165 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Casq1O09165 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Casq1O09165 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Casq1O09165 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Casq1O09165 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Casq1O09165 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Casq1O09165 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Casq1O09165 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Casq1O09165 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Casq1O09165 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Casq1O09165 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Casq1O09165 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Casq1O09165 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Casq1O09165 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Casq1O09165 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Casq1O09165 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Casq1O09165 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Casq1O09165 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Casq1O09165 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Casq1O09165 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Casq1O09165 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Casq1O09165 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Casq1O09165 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Casq1O09165 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Casq1O09165 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Casq1O09165 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Casq1O09165 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
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