Protein–RNA interactions for Protein: O08983

Hps1, Hermansky-Pudlak syndrome 1 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 704 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps1O08983 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hps1O08983 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hps1O08983 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hps1O08983 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hps1O08983 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Hps1O08983 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Hps1O08983 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Hps1O08983 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hps1O08983 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hps1O08983 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hps1O08983 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hps1O08983 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hps1O08983 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hps1O08983 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hps1O08983 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hps1O08983 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Hps1O08983 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Hps1O08983 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Hps1O08983 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Hps1O08983 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Hps1O08983 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Hps1O08983 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Hps1O08983 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Hps1O08983 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Hps1O08983 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Hps1O08983 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Hps1O08983 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Hps1O08983 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Hps1O08983 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hps1O08983 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hps1O08983 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hps1O08983 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hps1O08983 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hps1O08983 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hps1O08983 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hps1O08983 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hps1O08983 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hps1O08983 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Hps1O08983 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hps1O08983 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hps1O08983 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Hps1O08983 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hps1O08983 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Hps1O08983 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hps1O08983 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Hps1O08983 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hps1O08983 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hps1O08983 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hps1O08983 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hps1O08983 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hps1O08983 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hps1O08983 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hps1O08983 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hps1O08983 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hps1O08983 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hps1O08983 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hps1O08983 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hps1O08983 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hps1O08983 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hps1O08983 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hps1O08983 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hps1O08983 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hps1O08983 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hps1O08983 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hps1O08983 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hps1O08983 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hps1O08983 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hps1O08983 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hps1O08983 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hps1O08983 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Hps1O08983 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hps1O08983 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hps1O08983 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hps1O08983 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hps1O08983 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hps1O08983 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hps1O08983 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hps1O08983 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hps1O08983 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Hps1O08983 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Hps1O08983 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hps1O08983 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hps1O08983 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hps1O08983 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hps1O08983 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hps1O08983 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hps1O08983 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hps1O08983 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hps1O08983 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hps1O08983 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hps1O08983 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hps1O08983 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hps1O08983 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hps1O08983 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hps1O08983 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hps1O08983 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hps1O08983 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hps1O08983 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hps1O08983 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hps1O08983 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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