Protein–RNA interactions for Protein: O08786

Cckar, Cholecystokinin receptor type A, mousemouse

Predictions only

Length 436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CckarO08786 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CckarO08786 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
CckarO08786 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
CckarO08786 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CckarO08786 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CckarO08786 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CckarO08786 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CckarO08786 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
CckarO08786 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
CckarO08786 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CckarO08786 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CckarO08786 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CckarO08786 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
CckarO08786 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
CckarO08786 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CckarO08786 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CckarO08786 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CckarO08786 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
CckarO08786 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
CckarO08786 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
CckarO08786 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
CckarO08786 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
CckarO08786 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
CckarO08786 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
CckarO08786 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
CckarO08786 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
CckarO08786 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
CckarO08786 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
CckarO08786 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
CckarO08786 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
CckarO08786 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
CckarO08786 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
CckarO08786 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
CckarO08786 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
CckarO08786 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
CckarO08786 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
CckarO08786 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
CckarO08786 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
CckarO08786 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
CckarO08786 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
CckarO08786 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
CckarO08786 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
CckarO08786 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
CckarO08786 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
CckarO08786 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
CckarO08786 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
CckarO08786 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
CckarO08786 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
CckarO08786 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
CckarO08786 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
CckarO08786 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
CckarO08786 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
CckarO08786 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
CckarO08786 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
CckarO08786 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
CckarO08786 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
CckarO08786 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
CckarO08786 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
CckarO08786 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
CckarO08786 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
CckarO08786 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
CckarO08786 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
CckarO08786 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
CckarO08786 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
CckarO08786 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
CckarO08786 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
CckarO08786 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
CckarO08786 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
CckarO08786 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
CckarO08786 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
CckarO08786 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
CckarO08786 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
CckarO08786 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
CckarO08786 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
CckarO08786 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
CckarO08786 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
CckarO08786 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
CckarO08786 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
CckarO08786 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
CckarO08786 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
CckarO08786 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
CckarO08786 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
CckarO08786 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
CckarO08786 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
CckarO08786 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
CckarO08786 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
CckarO08786 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
CckarO08786 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
CckarO08786 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
CckarO08786 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
CckarO08786 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
CckarO08786 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
CckarO08786 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
CckarO08786 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
CckarO08786 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
CckarO08786 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
CckarO08786 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
CckarO08786 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC12.71□□□□□ -0.37
CckarO08786 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
CckarO08786 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.4 ms