Protein–RNA interactions for Protein: J3QMS8

Gm3415, Predicted gene 3415, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3415J3QMS8 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm3415J3QMS8 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm3415J3QMS8 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm3415J3QMS8 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm3415J3QMS8 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm3415J3QMS8 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm3415J3QMS8 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm3415J3QMS8 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gm3415J3QMS8 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gm3415J3QMS8 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gm3415J3QMS8 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm3415J3QMS8 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm3415J3QMS8 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm3415J3QMS8 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm3415J3QMS8 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm3415J3QMS8 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm3415J3QMS8 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm3415J3QMS8 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm3415J3QMS8 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm3415J3QMS8 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm3415J3QMS8 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm3415J3QMS8 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm3415J3QMS8 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm3415J3QMS8 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm3415J3QMS8 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm3415J3QMS8 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm3415J3QMS8 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm3415J3QMS8 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm3415J3QMS8 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm3415J3QMS8 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm3415J3QMS8 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm3415J3QMS8 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm3415J3QMS8 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm3415J3QMS8 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm3415J3QMS8 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm3415J3QMS8 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm3415J3QMS8 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm3415J3QMS8 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm3415J3QMS8 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm3415J3QMS8 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm3415J3QMS8 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm3415J3QMS8 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm3415J3QMS8 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm3415J3QMS8 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm3415J3QMS8 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm3415J3QMS8 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm3415J3QMS8 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm3415J3QMS8 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm3415J3QMS8 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm3415J3QMS8 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm3415J3QMS8 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm3415J3QMS8 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm3415J3QMS8 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm3415J3QMS8 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm3415J3QMS8 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm3415J3QMS8 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm3415J3QMS8 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm3415J3QMS8 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm3415J3QMS8 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm3415J3QMS8 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm3415J3QMS8 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm3415J3QMS8 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm3415J3QMS8 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm3415J3QMS8 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm3415J3QMS8 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm3415J3QMS8 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm3415J3QMS8 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm3415J3QMS8 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm3415J3QMS8 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm3415J3QMS8 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm3415J3QMS8 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm3415J3QMS8 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm3415J3QMS8 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm3415J3QMS8 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm3415J3QMS8 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm3415J3QMS8 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm3415J3QMS8 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm3415J3QMS8 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm3415J3QMS8 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm3415J3QMS8 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm3415J3QMS8 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm3415J3QMS8 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm3415J3QMS8 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm3415J3QMS8 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm3415J3QMS8 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm3415J3QMS8 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm3415J3QMS8 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm3415J3QMS8 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm3415J3QMS8 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm3415J3QMS8 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm3415J3QMS8 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm3415J3QMS8 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm3415J3QMS8 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm3415J3QMS8 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm3415J3QMS8 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm3415J3QMS8 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm3415J3QMS8 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm3415J3QMS8 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm3415J3QMS8 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm3415J3QMS8 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms