Protein–RNA interactions for Protein: J3QK59

Gm6176, Predicted gene 6176, mousemouse

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Length 301 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6176J3QK59 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
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Gm6176J3QK59 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm6176J3QK59 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm6176J3QK59 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm6176J3QK59 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm6176J3QK59 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
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Gm6176J3QK59 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm6176J3QK59 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm6176J3QK59 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
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Gm6176J3QK59 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm6176J3QK59 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
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Gm6176J3QK59 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
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Gm6176J3QK59 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
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Gm6176J3QK59 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
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Gm6176J3QK59 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
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Gm6176J3QK59 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm6176J3QK59 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
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Gm6176J3QK59 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm6176J3QK59 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
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Gm6176J3QK59 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm6176J3QK59 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm6176J3QK59 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm6176J3QK59 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm6176J3QK59 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm6176J3QK59 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm6176J3QK59 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
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Gm6176J3QK59 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms