Protein–RNA interactions for Protein: J3KMS6

Gm21818, MCG122238, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 170 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21818J3KMS6 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm21818J3KMS6 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm21818J3KMS6 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm21818J3KMS6 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm21818J3KMS6 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm21818J3KMS6 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm21818J3KMS6 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm21818J3KMS6 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm21818J3KMS6 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm21818J3KMS6 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm21818J3KMS6 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm21818J3KMS6 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm21818J3KMS6 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm21818J3KMS6 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm21818J3KMS6 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm21818J3KMS6 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm21818J3KMS6 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm21818J3KMS6 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm21818J3KMS6 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm21818J3KMS6 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm21818J3KMS6 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm21818J3KMS6 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm21818J3KMS6 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm21818J3KMS6 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm21818J3KMS6 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm21818J3KMS6 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm21818J3KMS6 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm21818J3KMS6 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm21818J3KMS6 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm21818J3KMS6 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm21818J3KMS6 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm21818J3KMS6 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm21818J3KMS6 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm21818J3KMS6 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm21818J3KMS6 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm21818J3KMS6 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm21818J3KMS6 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm21818J3KMS6 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm21818J3KMS6 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm21818J3KMS6 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm21818J3KMS6 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm21818J3KMS6 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm21818J3KMS6 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm21818J3KMS6 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm21818J3KMS6 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm21818J3KMS6 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm21818J3KMS6 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm21818J3KMS6 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm21818J3KMS6 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm21818J3KMS6 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm21818J3KMS6 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm21818J3KMS6 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm21818J3KMS6 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm21818J3KMS6 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm21818J3KMS6 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm21818J3KMS6 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm21818J3KMS6 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm21818J3KMS6 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm21818J3KMS6 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm21818J3KMS6 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm21818J3KMS6 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm21818J3KMS6 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm21818J3KMS6 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm21818J3KMS6 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm21818J3KMS6 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm21818J3KMS6 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm21818J3KMS6 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm21818J3KMS6 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm21818J3KMS6 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm21818J3KMS6 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm21818J3KMS6 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm21818J3KMS6 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm21818J3KMS6 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm21818J3KMS6 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm21818J3KMS6 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm21818J3KMS6 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm21818J3KMS6 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm21818J3KMS6 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm21818J3KMS6 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm21818J3KMS6 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm21818J3KMS6 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm21818J3KMS6 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm21818J3KMS6 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm21818J3KMS6 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm21818J3KMS6 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm21818J3KMS6 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm21818J3KMS6 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm21818J3KMS6 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm21818J3KMS6 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm21818J3KMS6 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm21818J3KMS6 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm21818J3KMS6 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm21818J3KMS6 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm21818J3KMS6 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm21818J3KMS6 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm21818J3KMS6 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm21818J3KMS6 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm21818J3KMS6 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm21818J3KMS6 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm21818J3KMS6 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms