Protein–RNA interactions for Protein: G3X9C2

Nccrp1, F-box only protein 50, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nccrp1G3X9C2 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nccrp1G3X9C2 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nccrp1G3X9C2 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nccrp1G3X9C2 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nccrp1G3X9C2 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nccrp1G3X9C2 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nccrp1G3X9C2 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nccrp1G3X9C2 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nccrp1G3X9C2 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Nccrp1G3X9C2 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nccrp1G3X9C2 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nccrp1G3X9C2 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nccrp1G3X9C2 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nccrp1G3X9C2 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nccrp1G3X9C2 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nccrp1G3X9C2 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nccrp1G3X9C2 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nccrp1G3X9C2 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Nccrp1G3X9C2 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nccrp1G3X9C2 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nccrp1G3X9C2 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nccrp1G3X9C2 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nccrp1G3X9C2 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nccrp1G3X9C2 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nccrp1G3X9C2 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nccrp1G3X9C2 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nccrp1G3X9C2 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Nccrp1G3X9C2 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nccrp1G3X9C2 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nccrp1G3X9C2 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nccrp1G3X9C2 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nccrp1G3X9C2 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nccrp1G3X9C2 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nccrp1G3X9C2 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nccrp1G3X9C2 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nccrp1G3X9C2 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Nccrp1G3X9C2 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Nccrp1G3X9C2 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nccrp1G3X9C2 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nccrp1G3X9C2 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nccrp1G3X9C2 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nccrp1G3X9C2 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nccrp1G3X9C2 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nccrp1G3X9C2 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nccrp1G3X9C2 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nccrp1G3X9C2 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nccrp1G3X9C2 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nccrp1G3X9C2 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nccrp1G3X9C2 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nccrp1G3X9C2 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nccrp1G3X9C2 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nccrp1G3X9C2 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nccrp1G3X9C2 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nccrp1G3X9C2 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nccrp1G3X9C2 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nccrp1G3X9C2 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nccrp1G3X9C2 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nccrp1G3X9C2 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nccrp1G3X9C2 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Nccrp1G3X9C2 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Nccrp1G3X9C2 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nccrp1G3X9C2 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nccrp1G3X9C2 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nccrp1G3X9C2 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nccrp1G3X9C2 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nccrp1G3X9C2 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nccrp1G3X9C2 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nccrp1G3X9C2 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Nccrp1G3X9C2 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nccrp1G3X9C2 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nccrp1G3X9C2 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nccrp1G3X9C2 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nccrp1G3X9C2 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nccrp1G3X9C2 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nccrp1G3X9C2 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nccrp1G3X9C2 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nccrp1G3X9C2 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nccrp1G3X9C2 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nccrp1G3X9C2 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nccrp1G3X9C2 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nccrp1G3X9C2 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nccrp1G3X9C2 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nccrp1G3X9C2 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nccrp1G3X9C2 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nccrp1G3X9C2 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nccrp1G3X9C2 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nccrp1G3X9C2 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nccrp1G3X9C2 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nccrp1G3X9C2 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nccrp1G3X9C2 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nccrp1G3X9C2 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nccrp1G3X9C2 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nccrp1G3X9C2 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nccrp1G3X9C2 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nccrp1G3X9C2 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nccrp1G3X9C2 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nccrp1G3X9C2 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nccrp1G3X9C2 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nccrp1G3X9C2 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nccrp1G3X9C2 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms