Protein–RNA interactions for Protein: F8VPU6

Usp9y, Ubiquitin-specific peptidase 9, Y chromosome, mousemouse

Predictions only

Length 2,556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9yF8VPU6 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Usp9yF8VPU6 Gm4909-201ENSMUST00000118749 794 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Usp9yF8VPU6 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Usp9yF8VPU6 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Usp9yF8VPU6 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Usp9yF8VPU6 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Usp9yF8VPU6 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Usp9yF8VPU6 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Usp9yF8VPU6 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Usp9yF8VPU6 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Usp9yF8VPU6 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Usp9yF8VPU6 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Usp9yF8VPU6 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Usp9yF8VPU6 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Usp9yF8VPU6 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Usp9yF8VPU6 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Usp9yF8VPU6 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Usp9yF8VPU6 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Usp9yF8VPU6 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Usp9yF8VPU6 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Usp9yF8VPU6 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Usp9yF8VPU6 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Usp9yF8VPU6 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Usp9yF8VPU6 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Usp9yF8VPU6 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Usp9yF8VPU6 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Usp9yF8VPU6 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Usp9yF8VPU6 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Usp9yF8VPU6 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Usp9yF8VPU6 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Usp9yF8VPU6 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Usp9yF8VPU6 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Usp9yF8VPU6 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Usp9yF8VPU6 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Usp9yF8VPU6 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Usp9yF8VPU6 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Usp9yF8VPU6 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Usp9yF8VPU6 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Usp9yF8VPU6 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Usp9yF8VPU6 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Usp9yF8VPU6 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Usp9yF8VPU6 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Usp9yF8VPU6 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Usp9yF8VPU6 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Usp9yF8VPU6 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Usp9yF8VPU6 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Usp9yF8VPU6 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Usp9yF8VPU6 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Usp9yF8VPU6 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Usp9yF8VPU6 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Usp9yF8VPU6 Gm6407-201ENSMUST00000176468 549 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Usp9yF8VPU6 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Usp9yF8VPU6 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Usp9yF8VPU6 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Usp9yF8VPU6 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Usp9yF8VPU6 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Usp9yF8VPU6 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Usp9yF8VPU6 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Usp9yF8VPU6 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Usp9yF8VPU6 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Usp9yF8VPU6 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Usp9yF8VPU6 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Usp9yF8VPU6 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Usp9yF8VPU6 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Usp9yF8VPU6 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Usp9yF8VPU6 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Usp9yF8VPU6 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Usp9yF8VPU6 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Usp9yF8VPU6 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Usp9yF8VPU6 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Usp9yF8VPU6 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Usp9yF8VPU6 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Usp9yF8VPU6 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Usp9yF8VPU6 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Usp9yF8VPU6 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Usp9yF8VPU6 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Usp9yF8VPU6 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Usp9yF8VPU6 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Usp9yF8VPU6 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Usp9yF8VPU6 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Usp9yF8VPU6 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Usp9yF8VPU6 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Usp9yF8VPU6 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Usp9yF8VPU6 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Usp9yF8VPU6 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Usp9yF8VPU6 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Usp9yF8VPU6 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Usp9yF8VPU6 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Usp9yF8VPU6 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Usp9yF8VPU6 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Usp9yF8VPU6 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Usp9yF8VPU6 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Usp9yF8VPU6 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Usp9yF8VPU6 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Usp9yF8VPU6 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Usp9yF8VPU6 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Usp9yF8VPU6 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Usp9yF8VPU6 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Usp9yF8VPU6 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Usp9yF8VPU6 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms