Protein–RNA interactions for Protein: F8VPU2

Farp1, FERM, ARHGEF and pleckstrin domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,048 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Farp1F8VPU2 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Farp1F8VPU2 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Farp1F8VPU2 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Farp1F8VPU2 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Farp1F8VPU2 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Farp1F8VPU2 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Farp1F8VPU2 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Farp1F8VPU2 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Farp1F8VPU2 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Farp1F8VPU2 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Farp1F8VPU2 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Farp1F8VPU2 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Farp1F8VPU2 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Farp1F8VPU2 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Farp1F8VPU2 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Farp1F8VPU2 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Farp1F8VPU2 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Farp1F8VPU2 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Farp1F8VPU2 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Farp1F8VPU2 Sox5it-201ENSMUST00000144026 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Farp1F8VPU2 Gm15952-202ENSMUST00000144542 556 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Farp1F8VPU2 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Farp1F8VPU2 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Farp1F8VPU2 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Farp1F8VPU2 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Farp1F8VPU2 Gm38216-201ENSMUST00000194872 1214 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Farp1F8VPU2 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Farp1F8VPU2 Gm45462-201ENSMUST00000211267 792 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Farp1F8VPU2 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Farp1F8VPU2 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Farp1F8VPU2 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Farp1F8VPU2 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Farp1F8VPU2 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Farp1F8VPU2 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Farp1F8VPU2 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Farp1F8VPU2 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Farp1F8VPU2 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Farp1F8VPU2 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Farp1F8VPU2 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Farp1F8VPU2 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Farp1F8VPU2 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Farp1F8VPU2 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Farp1F8VPU2 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Farp1F8VPU2 Gm14740-201ENSMUST00000118538 1150 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Farp1F8VPU2 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Farp1F8VPU2 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Farp1F8VPU2 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Farp1F8VPU2 Gm37641-201ENSMUST00000193837 239 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Farp1F8VPU2 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Farp1F8VPU2 Gm19080-201ENSMUST00000196082 550 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Farp1F8VPU2 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Farp1F8VPU2 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Farp1F8VPU2 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Farp1F8VPU2 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Farp1F8VPU2 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Farp1F8VPU2 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Farp1F8VPU2 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Farp1F8VPU2 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Farp1F8VPU2 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Farp1F8VPU2 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Farp1F8VPU2 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Farp1F8VPU2 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Farp1F8VPU2 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Farp1F8VPU2 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Farp1F8VPU2 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Farp1F8VPU2 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Farp1F8VPU2 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Farp1F8VPU2 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Farp1F8VPU2 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Farp1F8VPU2 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Farp1F8VPU2 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Farp1F8VPU2 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Farp1F8VPU2 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Farp1F8VPU2 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Farp1F8VPU2 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Farp1F8VPU2 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Farp1F8VPU2 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Farp1F8VPU2 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Farp1F8VPU2 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Farp1F8VPU2 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Farp1F8VPU2 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Farp1F8VPU2 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Farp1F8VPU2 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Farp1F8VPU2 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Farp1F8VPU2 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Farp1F8VPU2 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Farp1F8VPU2 Gm14201-201ENSMUST00000117627 289 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Farp1F8VPU2 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Farp1F8VPU2 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Farp1F8VPU2 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Farp1F8VPU2 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Farp1F8VPU2 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Farp1F8VPU2 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Farp1F8VPU2 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Farp1F8VPU2 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Farp1F8VPU2 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Farp1F8VPU2 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Farp1F8VPU2 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Farp1F8VPU2 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Farp1F8VPU2 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms