Protein–RNA interactions for Protein: F7CXU4

H2-M1, Histocompatibility 2, M region locus 1, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M1F7CXU4 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
H2-M1F7CXU4 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
H2-M1F7CXU4 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
H2-M1F7CXU4 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
H2-M1F7CXU4 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
H2-M1F7CXU4 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
H2-M1F7CXU4 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
H2-M1F7CXU4 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
H2-M1F7CXU4 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
H2-M1F7CXU4 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
H2-M1F7CXU4 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
H2-M1F7CXU4 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
H2-M1F7CXU4 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
H2-M1F7CXU4 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
H2-M1F7CXU4 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
H2-M1F7CXU4 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
H2-M1F7CXU4 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
H2-M1F7CXU4 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
H2-M1F7CXU4 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
H2-M1F7CXU4 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
H2-M1F7CXU4 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
H2-M1F7CXU4 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
H2-M1F7CXU4 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
H2-M1F7CXU4 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
H2-M1F7CXU4 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
H2-M1F7CXU4 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
H2-M1F7CXU4 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
H2-M1F7CXU4 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
H2-M1F7CXU4 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
H2-M1F7CXU4 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
H2-M1F7CXU4 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
H2-M1F7CXU4 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
H2-M1F7CXU4 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
H2-M1F7CXU4 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
H2-M1F7CXU4 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
H2-M1F7CXU4 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
H2-M1F7CXU4 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
H2-M1F7CXU4 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
H2-M1F7CXU4 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
H2-M1F7CXU4 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
H2-M1F7CXU4 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
H2-M1F7CXU4 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
H2-M1F7CXU4 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
H2-M1F7CXU4 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
H2-M1F7CXU4 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
H2-M1F7CXU4 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
H2-M1F7CXU4 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
H2-M1F7CXU4 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
H2-M1F7CXU4 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
H2-M1F7CXU4 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
H2-M1F7CXU4 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
H2-M1F7CXU4 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
H2-M1F7CXU4 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
H2-M1F7CXU4 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
H2-M1F7CXU4 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC13□□□□□ -0.33
H2-M1F7CXU4 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC13□□□□□ -0.33
H2-M1F7CXU4 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
H2-M1F7CXU4 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
H2-M1F7CXU4 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
H2-M1F7CXU4 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC13□□□□□ -0.33
H2-M1F7CXU4 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
H2-M1F7CXU4 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
H2-M1F7CXU4 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
H2-M1F7CXU4 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
H2-M1F7CXU4 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
H2-M1F7CXU4 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
H2-M1F7CXU4 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
H2-M1F7CXU4 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
H2-M1F7CXU4 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
H2-M1F7CXU4 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC13□□□□□ -0.33
H2-M1F7CXU4 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC13□□□□□ -0.33
H2-M1F7CXU4 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC13□□□□□ -0.33
H2-M1F7CXU4 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC13□□□□□ -0.33
H2-M1F7CXU4 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC13□□□□□ -0.33
H2-M1F7CXU4 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
H2-M1F7CXU4 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
H2-M1F7CXU4 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
H2-M1F7CXU4 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
H2-M1F7CXU4 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
H2-M1F7CXU4 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
H2-M1F7CXU4 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
H2-M1F7CXU4 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
H2-M1F7CXU4 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
H2-M1F7CXU4 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
H2-M1F7CXU4 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
H2-M1F7CXU4 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
H2-M1F7CXU4 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
H2-M1F7CXU4 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
H2-M1F7CXU4 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
H2-M1F7CXU4 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
H2-M1F7CXU4 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
H2-M1F7CXU4 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
H2-M1F7CXU4 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
H2-M1F7CXU4 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
H2-M1F7CXU4 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
H2-M1F7CXU4 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
H2-M1F7CXU4 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
H2-M1F7CXU4 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
H2-M1F7CXU4 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
H2-M1F7CXU4 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.2 ms