Protein–RNA interactions for Protein: F6Z9R1

Gm20538, Predicted gene 20538 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 75 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20538F6Z9R1 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Gm20538F6Z9R1 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Gm20538F6Z9R1 Myh10-201ENSMUST00000018887 7667 ntTSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Gm20538F6Z9R1 Ddx11-201ENSMUST00000163605 4149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Gm20538F6Z9R1 Lrtm2-204ENSMUST00000168793 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Gm20538F6Z9R1 Setd7-201ENSMUST00000037141 7411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Gm20538F6Z9R1 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Gm20538F6Z9R1 Gm9271-201ENSMUST00000185988 2580 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Gm20538F6Z9R1 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Gm20538F6Z9R1 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Gm20538F6Z9R1 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Gm20538F6Z9R1 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Gm20538F6Z9R1 Zfp532-202ENSMUST00000169679 5003 ntTSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Gm20538F6Z9R1 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Gm20538F6Z9R1 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Gm20538F6Z9R1 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Gm20538F6Z9R1 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Gm20538F6Z9R1 Gfm2-208ENSMUST00000161639 3157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Gm20538F6Z9R1 Zfp959-201ENSMUST00000054780 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Gm20538F6Z9R1 Zfp93-201ENSMUST00000032696 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Gm20538F6Z9R1 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Gm20538F6Z9R1 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Gm20538F6Z9R1 Gm37367-201ENSMUST00000191771 2602 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Gm20538F6Z9R1 Scn8a-203ENSMUST00000108908 7030 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Gm20538F6Z9R1 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Gm20538F6Z9R1 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Gm20538F6Z9R1 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Gm20538F6Z9R1 Csf1r-202ENSMUST00000115268 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Gm20538F6Z9R1 Ncbp3-201ENSMUST00000021135 12106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Gm20538F6Z9R1 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Gm20538F6Z9R1 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Gm20538F6Z9R1 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Gm20538F6Z9R1 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Gm20538F6Z9R1 Polq-202ENSMUST00000071452 7290 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Gm20538F6Z9R1 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Gm20538F6Z9R1 Gm9220-201ENSMUST00000190721 2544 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Gm20538F6Z9R1 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Gm20538F6Z9R1 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Gm20538F6Z9R1 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Gm20538F6Z9R1 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Gm20538F6Z9R1 C4b-201ENSMUST00000069507 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Gm20538F6Z9R1 Hs6st2-202ENSMUST00000114871 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.33
Gm20538F6Z9R1 Gm43931-201ENSMUST00000204817 2870 ntBASIC6.71□□□□□ -1.33
Gm20538F6Z9R1 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.33
Gm20538F6Z9R1 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.33
Gm20538F6Z9R1 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.33
Gm20538F6Z9R1 Sectm1a-201ENSMUST00000026162 1692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.33
Gm20538F6Z9R1 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.33
Gm20538F6Z9R1 Olfr943-202ENSMUST00000213176 8275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.33
Gm20538F6Z9R1 Gm34425-201ENSMUST00000216269 3079 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.33
Gm20538F6Z9R1 Lsamp-208ENSMUST00000189358 2766 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.33
Gm20538F6Z9R1 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.33
Gm20538F6Z9R1 Zbtb21-203ENSMUST00000113734 6010 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC6.71□□□□□ -1.33
Gm20538F6Z9R1 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC6.71□□□□□ -1.33
Gm20538F6Z9R1 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.33
Gm20538F6Z9R1 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.33
Gm20538F6Z9R1 Gm43143-201ENSMUST00000196083 2023 ntBASIC6.71□□□□□ -1.33
Gm20538F6Z9R1 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC6.71□□□□□ -1.33
Gm20538F6Z9R1 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Gm20538F6Z9R1 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Gm20538F6Z9R1 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Gm20538F6Z9R1 Rcor3-202ENSMUST00000110849 3791 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Gm20538F6Z9R1 Fbrs-201ENSMUST00000048896 2650 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Gm20538F6Z9R1 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Gm20538F6Z9R1 Dysf-202ENSMUST00000089595 6613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Gm20538F6Z9R1 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Gm20538F6Z9R1 Cox17-202ENSMUST00000120495 3690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Gm20538F6Z9R1 Npr2-201ENSMUST00000030191 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Gm20538F6Z9R1 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Gm20538F6Z9R1 Cntrl-201ENSMUST00000028235 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Gm20538F6Z9R1 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Gm20538F6Z9R1 Sema4a-201ENSMUST00000029700 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Gm20538F6Z9R1 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Gm20538F6Z9R1 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Gm20538F6Z9R1 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Gm20538F6Z9R1 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Gm20538F6Z9R1 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Gm20538F6Z9R1 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Gm20538F6Z9R1 Exosc10-201ENSMUST00000017408 2790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Gm20538F6Z9R1 Npy1r-202ENSMUST00000212588 2770 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Gm20538F6Z9R1 3632451O06Rik-201ENSMUST00000036972 8831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Gm20538F6Z9R1 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Gm20538F6Z9R1 Mrgprd-201ENSMUST00000062163 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Gm20538F6Z9R1 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Gm20538F6Z9R1 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Gm20538F6Z9R1 Snx31-203ENSMUST00000161202 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Gm20538F6Z9R1 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Gm20538F6Z9R1 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Gm20538F6Z9R1 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Gm20538F6Z9R1 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Gm20538F6Z9R1 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Gm20538F6Z9R1 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Gm20538F6Z9R1 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Gm20538F6Z9R1 Ablim2-206ENSMUST00000114206 3528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Gm20538F6Z9R1 Ncam1-203ENSMUST00000192584 2525 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Gm20538F6Z9R1 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Gm20538F6Z9R1 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Gm20538F6Z9R1 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Gm20538F6Z9R1 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Gm20538F6Z9R1 Ugt1a10-201ENSMUST00000113142 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms