Protein–RNA interactions for Protein: F6VRN1

Smgc, Submandibular gland protein C (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 385 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SmgcF6VRN1 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SmgcF6VRN1 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SmgcF6VRN1 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SmgcF6VRN1 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SmgcF6VRN1 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SmgcF6VRN1 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SmgcF6VRN1 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SmgcF6VRN1 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SmgcF6VRN1 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SmgcF6VRN1 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SmgcF6VRN1 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
SmgcF6VRN1 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SmgcF6VRN1 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SmgcF6VRN1 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SmgcF6VRN1 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SmgcF6VRN1 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SmgcF6VRN1 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SmgcF6VRN1 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SmgcF6VRN1 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
SmgcF6VRN1 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SmgcF6VRN1 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SmgcF6VRN1 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SmgcF6VRN1 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SmgcF6VRN1 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SmgcF6VRN1 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SmgcF6VRN1 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SmgcF6VRN1 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SmgcF6VRN1 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SmgcF6VRN1 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SmgcF6VRN1 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SmgcF6VRN1 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SmgcF6VRN1 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SmgcF6VRN1 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SmgcF6VRN1 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SmgcF6VRN1 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
SmgcF6VRN1 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SmgcF6VRN1 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SmgcF6VRN1 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SmgcF6VRN1 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SmgcF6VRN1 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
SmgcF6VRN1 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SmgcF6VRN1 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SmgcF6VRN1 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SmgcF6VRN1 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SmgcF6VRN1 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SmgcF6VRN1 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SmgcF6VRN1 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
SmgcF6VRN1 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SmgcF6VRN1 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SmgcF6VRN1 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SmgcF6VRN1 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
SmgcF6VRN1 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
SmgcF6VRN1 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SmgcF6VRN1 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SmgcF6VRN1 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SmgcF6VRN1 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SmgcF6VRN1 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
SmgcF6VRN1 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SmgcF6VRN1 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SmgcF6VRN1 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SmgcF6VRN1 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SmgcF6VRN1 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SmgcF6VRN1 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SmgcF6VRN1 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SmgcF6VRN1 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SmgcF6VRN1 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
SmgcF6VRN1 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
SmgcF6VRN1 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
SmgcF6VRN1 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
SmgcF6VRN1 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
SmgcF6VRN1 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC14.46□□□□□ -0.1
SmgcF6VRN1 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SmgcF6VRN1 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC14.45□□□□□ -0.1
SmgcF6VRN1 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SmgcF6VRN1 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SmgcF6VRN1 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
SmgcF6VRN1 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
SmgcF6VRN1 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
SmgcF6VRN1 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
SmgcF6VRN1 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
SmgcF6VRN1 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
SmgcF6VRN1 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SmgcF6VRN1 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
SmgcF6VRN1 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
SmgcF6VRN1 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
SmgcF6VRN1 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
SmgcF6VRN1 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SmgcF6VRN1 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SmgcF6VRN1 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SmgcF6VRN1 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SmgcF6VRN1 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SmgcF6VRN1 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SmgcF6VRN1 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SmgcF6VRN1 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SmgcF6VRN1 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SmgcF6VRN1 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SmgcF6VRN1 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SmgcF6VRN1 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SmgcF6VRN1 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SmgcF6VRN1 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms