Protein–RNA interactions for Protein: F6V035

Ccdc149, Coiled-coil domain-containing 149, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc149F6V035 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc149F6V035 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc149F6V035 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc149F6V035 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc149F6V035 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc149F6V035 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc149F6V035 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc149F6V035 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc149F6V035 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc149F6V035 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc149F6V035 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc149F6V035 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc149F6V035 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc149F6V035 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc149F6V035 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc149F6V035 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc149F6V035 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc149F6V035 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc149F6V035 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc149F6V035 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc149F6V035 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc149F6V035 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc149F6V035 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Ccdc149F6V035 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc149F6V035 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc149F6V035 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc149F6V035 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc149F6V035 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc149F6V035 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc149F6V035 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc149F6V035 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc149F6V035 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc149F6V035 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc149F6V035 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc149F6V035 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc149F6V035 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc149F6V035 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc149F6V035 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc149F6V035 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc149F6V035 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc149F6V035 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc149F6V035 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Ccdc149F6V035 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Ccdc149F6V035 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc149F6V035 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc149F6V035 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc149F6V035 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc149F6V035 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc149F6V035 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc149F6V035 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc149F6V035 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Ccdc149F6V035 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Ccdc149F6V035 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc149F6V035 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc149F6V035 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc149F6V035 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Ccdc149F6V035 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Ccdc149F6V035 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Ccdc149F6V035 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc149F6V035 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Ccdc149F6V035 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc149F6V035 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc149F6V035 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc149F6V035 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc149F6V035 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc149F6V035 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc149F6V035 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc149F6V035 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc149F6V035 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc149F6V035 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc149F6V035 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc149F6V035 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc149F6V035 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc149F6V035 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc149F6V035 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc149F6V035 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc149F6V035 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc149F6V035 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc149F6V035 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc149F6V035 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc149F6V035 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc149F6V035 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc149F6V035 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc149F6V035 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc149F6V035 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc149F6V035 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc149F6V035 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc149F6V035 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc149F6V035 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc149F6V035 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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