Protein–RNA interactions for Protein: F6SW83

Gm10477, Predicted gene 10477, mousemouse

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Length 55 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm10477F6SW83 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm10477F6SW83 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm10477F6SW83 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm10477F6SW83 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm10477F6SW83 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm10477F6SW83 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm10477F6SW83 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm10477F6SW83 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm10477F6SW83 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm10477F6SW83 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm10477F6SW83 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm10477F6SW83 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm10477F6SW83 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm10477F6SW83 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm10477F6SW83 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm10477F6SW83 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm10477F6SW83 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm10477F6SW83 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm10477F6SW83 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm10477F6SW83 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm10477F6SW83 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm10477F6SW83 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm10477F6SW83 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm10477F6SW83 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm10477F6SW83 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm10477F6SW83 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm10477F6SW83 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm10477F6SW83 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm10477F6SW83 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm10477F6SW83 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm10477F6SW83 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm10477F6SW83 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm10477F6SW83 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm10477F6SW83 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm10477F6SW83 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm10477F6SW83 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm10477F6SW83 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm10477F6SW83 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm10477F6SW83 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm10477F6SW83 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm10477F6SW83 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm10477F6SW83 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm10477F6SW83 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm10477F6SW83 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm10477F6SW83 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm10477F6SW83 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm10477F6SW83 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm10477F6SW83 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm10477F6SW83 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm10477F6SW83 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm10477F6SW83 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm10477F6SW83 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm10477F6SW83 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm10477F6SW83 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm10477F6SW83 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm10477F6SW83 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm10477F6SW83 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
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Gm10477F6SW83 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm10477F6SW83 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm10477F6SW83 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm10477F6SW83 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm10477F6SW83 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm10477F6SW83 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm10477F6SW83 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm10477F6SW83 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm10477F6SW83 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm10477F6SW83 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm10477F6SW83 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm10477F6SW83 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm10477F6SW83 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm10477F6SW83 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm10477F6SW83 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm10477F6SW83 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm10477F6SW83 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm10477F6SW83 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm10477F6SW83 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm10477F6SW83 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm10477F6SW83 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm10477F6SW83 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm10477F6SW83 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm10477F6SW83 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm10477F6SW83 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm10477F6SW83 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm10477F6SW83 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm10477F6SW83 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm10477F6SW83 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm10477F6SW83 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm10477F6SW83 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm10477F6SW83 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm10477F6SW83 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm10477F6SW83 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm10477F6SW83 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm10477F6SW83 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm10477F6SW83 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm10477F6SW83 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm10477F6SW83 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm10477F6SW83 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm10477F6SW83 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm10477F6SW83 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
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