Protein–RNA interactions for Protein: F6SEU4

Syngap1, Ras/Rap GTPase-activating protein SynGAP, mousemouse

Predictions only

Length 1,340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syngap1F6SEU4 Nkx2-2os-202ENSMUST00000184407 458 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Syngap1F6SEU4 AC159747.1-201ENSMUST00000219903 265 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Syngap1F6SEU4 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Syngap1F6SEU4 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Syngap1F6SEU4 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Syngap1F6SEU4 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Syngap1F6SEU4 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Syngap1F6SEU4 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Syngap1F6SEU4 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Syngap1F6SEU4 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Syngap1F6SEU4 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Syngap1F6SEU4 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Syngap1F6SEU4 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Syngap1F6SEU4 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Syngap1F6SEU4 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Syngap1F6SEU4 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Syngap1F6SEU4 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Syngap1F6SEU4 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Syngap1F6SEU4 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Syngap1F6SEU4 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Syngap1F6SEU4 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Syngap1F6SEU4 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Syngap1F6SEU4 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Syngap1F6SEU4 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Syngap1F6SEU4 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Syngap1F6SEU4 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Syngap1F6SEU4 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Syngap1F6SEU4 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Syngap1F6SEU4 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Syngap1F6SEU4 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Syngap1F6SEU4 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Syngap1F6SEU4 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Syngap1F6SEU4 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Syngap1F6SEU4 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Syngap1F6SEU4 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Syngap1F6SEU4 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Syngap1F6SEU4 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Syngap1F6SEU4 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Syngap1F6SEU4 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Syngap1F6SEU4 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Syngap1F6SEU4 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Syngap1F6SEU4 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Syngap1F6SEU4 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Syngap1F6SEU4 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Syngap1F6SEU4 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Syngap1F6SEU4 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Syngap1F6SEU4 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Syngap1F6SEU4 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Syngap1F6SEU4 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Syngap1F6SEU4 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Syngap1F6SEU4 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Syngap1F6SEU4 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Syngap1F6SEU4 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Syngap1F6SEU4 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Syngap1F6SEU4 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Syngap1F6SEU4 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Syngap1F6SEU4 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Syngap1F6SEU4 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Syngap1F6SEU4 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Syngap1F6SEU4 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Syngap1F6SEU4 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Syngap1F6SEU4 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Syngap1F6SEU4 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Syngap1F6SEU4 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Syngap1F6SEU4 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Syngap1F6SEU4 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Syngap1F6SEU4 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Syngap1F6SEU4 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Syngap1F6SEU4 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Syngap1F6SEU4 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Syngap1F6SEU4 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Syngap1F6SEU4 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Syngap1F6SEU4 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Syngap1F6SEU4 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Syngap1F6SEU4 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Syngap1F6SEU4 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Syngap1F6SEU4 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Syngap1F6SEU4 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Syngap1F6SEU4 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Syngap1F6SEU4 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Syngap1F6SEU4 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Syngap1F6SEU4 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Syngap1F6SEU4 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Syngap1F6SEU4 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Syngap1F6SEU4 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Syngap1F6SEU4 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Syngap1F6SEU4 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Syngap1F6SEU4 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Syngap1F6SEU4 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Syngap1F6SEU4 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Syngap1F6SEU4 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Syngap1F6SEU4 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Syngap1F6SEU4 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Syngap1F6SEU4 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Syngap1F6SEU4 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Syngap1F6SEU4 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Syngap1F6SEU4 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Syngap1F6SEU4 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Syngap1F6SEU4 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Syngap1F6SEU4 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms