Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9P8

Rdh16f1, RDH16 family member 1, mousemouse

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Length 317 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh16f1E9Q9P8 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rdh16f1E9Q9P8 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rdh16f1E9Q9P8 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rdh16f1E9Q9P8 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rdh16f1E9Q9P8 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rdh16f1E9Q9P8 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rdh16f1E9Q9P8 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rdh16f1E9Q9P8 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rdh16f1E9Q9P8 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rdh16f1E9Q9P8 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rdh16f1E9Q9P8 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rdh16f1E9Q9P8 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rdh16f1E9Q9P8 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rdh16f1E9Q9P8 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rdh16f1E9Q9P8 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rdh16f1E9Q9P8 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rdh16f1E9Q9P8 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rdh16f1E9Q9P8 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rdh16f1E9Q9P8 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rdh16f1E9Q9P8 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rdh16f1E9Q9P8 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rdh16f1E9Q9P8 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
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Rdh16f1E9Q9P8 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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Rdh16f1E9Q9P8 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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Rdh16f1E9Q9P8 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rdh16f1E9Q9P8 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rdh16f1E9Q9P8 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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Rdh16f1E9Q9P8 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rdh16f1E9Q9P8 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
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Rdh16f1E9Q9P8 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rdh16f1E9Q9P8 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rdh16f1E9Q9P8 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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Rdh16f1E9Q9P8 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rdh16f1E9Q9P8 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rdh16f1E9Q9P8 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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Rdh16f1E9Q9P8 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rdh16f1E9Q9P8 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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Rdh16f1E9Q9P8 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rdh16f1E9Q9P8 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rdh16f1E9Q9P8 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rdh16f1E9Q9P8 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rdh16f1E9Q9P8 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rdh16f1E9Q9P8 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rdh16f1E9Q9P8 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rdh16f1E9Q9P8 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rdh16f1E9Q9P8 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rdh16f1E9Q9P8 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rdh16f1E9Q9P8 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rdh16f1E9Q9P8 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rdh16f1E9Q9P8 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rdh16f1E9Q9P8 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rdh16f1E9Q9P8 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rdh16f1E9Q9P8 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Rdh16f1E9Q9P8 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rdh16f1E9Q9P8 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rdh16f1E9Q9P8 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rdh16f1E9Q9P8 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rdh16f1E9Q9P8 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rdh16f1E9Q9P8 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
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