Protein–RNA interactions for Protein: E9Q8R3

Gm8257, Predicted pseudogene 8257, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8257E9Q8R3 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm8257E9Q8R3 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm8257E9Q8R3 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm8257E9Q8R3 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm8257E9Q8R3 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Gm8257E9Q8R3 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Gm8257E9Q8R3 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Gm8257E9Q8R3 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Gm8257E9Q8R3 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Gm8257E9Q8R3 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Gm8257E9Q8R3 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Gm8257E9Q8R3 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Gm8257E9Q8R3 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Gm8257E9Q8R3 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Gm8257E9Q8R3 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm8257E9Q8R3 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm8257E9Q8R3 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm8257E9Q8R3 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm8257E9Q8R3 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm8257E9Q8R3 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm8257E9Q8R3 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm8257E9Q8R3 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm8257E9Q8R3 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm8257E9Q8R3 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm8257E9Q8R3 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm8257E9Q8R3 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm8257E9Q8R3 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm8257E9Q8R3 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm8257E9Q8R3 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Gm8257E9Q8R3 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm8257E9Q8R3 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm8257E9Q8R3 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Gm8257E9Q8R3 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Gm8257E9Q8R3 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm8257E9Q8R3 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm8257E9Q8R3 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm8257E9Q8R3 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm8257E9Q8R3 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm8257E9Q8R3 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm8257E9Q8R3 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm8257E9Q8R3 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm8257E9Q8R3 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm8257E9Q8R3 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm8257E9Q8R3 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm8257E9Q8R3 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm8257E9Q8R3 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm8257E9Q8R3 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm8257E9Q8R3 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Gm8257E9Q8R3 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm8257E9Q8R3 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm8257E9Q8R3 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm8257E9Q8R3 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Gm8257E9Q8R3 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Gm8257E9Q8R3 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Gm8257E9Q8R3 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm8257E9Q8R3 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm8257E9Q8R3 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm8257E9Q8R3 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm8257E9Q8R3 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Gm8257E9Q8R3 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm8257E9Q8R3 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Gm8257E9Q8R3 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm8257E9Q8R3 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm8257E9Q8R3 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm8257E9Q8R3 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm8257E9Q8R3 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm8257E9Q8R3 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm8257E9Q8R3 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm8257E9Q8R3 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm8257E9Q8R3 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm8257E9Q8R3 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm8257E9Q8R3 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm8257E9Q8R3 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm8257E9Q8R3 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm8257E9Q8R3 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm8257E9Q8R3 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm8257E9Q8R3 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm8257E9Q8R3 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm8257E9Q8R3 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
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