Protein–RNA interactions for Protein: E9Q8F9

6030445D17Rik, RIKEN cDNA 6030445D17 gene, mousemouse

Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
6030445D17RikE9Q8F9 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
6030445D17RikE9Q8F9 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.97□□□□□ -0.97
6030445D17RikE9Q8F9 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
6030445D17RikE9Q8F9 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.97□□□□□ -0.97
6030445D17RikE9Q8F9 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
6030445D17RikE9Q8F9 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
6030445D17RikE9Q8F9 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
6030445D17RikE9Q8F9 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC8.97□□□□□ -0.97
6030445D17RikE9Q8F9 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
6030445D17RikE9Q8F9 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
6030445D17RikE9Q8F9 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
6030445D17RikE9Q8F9 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC8.97□□□□□ -0.97
6030445D17RikE9Q8F9 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC8.97□□□□□ -0.97
6030445D17RikE9Q8F9 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC8.97□□□□□ -0.97
6030445D17RikE9Q8F9 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
6030445D17RikE9Q8F9 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
6030445D17RikE9Q8F9 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.97□□□□□ -0.97
6030445D17RikE9Q8F9 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC8.97□□□□□ -0.97
6030445D17RikE9Q8F9 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC8.97□□□□□ -0.97
6030445D17RikE9Q8F9 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC8.97□□□□□ -0.97
6030445D17RikE9Q8F9 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
6030445D17RikE9Q8F9 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC8.97□□□□□ -0.97
6030445D17RikE9Q8F9 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC8.97□□□□□ -0.97
6030445D17RikE9Q8F9 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC8.97□□□□□ -0.97
6030445D17RikE9Q8F9 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.97□□□□□ -0.97
6030445D17RikE9Q8F9 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
6030445D17RikE9Q8F9 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
6030445D17RikE9Q8F9 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
6030445D17RikE9Q8F9 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC8.97□□□□□ -0.97
6030445D17RikE9Q8F9 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.97□□□□□ -0.97
6030445D17RikE9Q8F9 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
6030445D17RikE9Q8F9 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
6030445D17RikE9Q8F9 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
6030445D17RikE9Q8F9 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
6030445D17RikE9Q8F9 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
6030445D17RikE9Q8F9 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
6030445D17RikE9Q8F9 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC8.97□□□□□ -0.97
6030445D17RikE9Q8F9 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
6030445D17RikE9Q8F9 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
6030445D17RikE9Q8F9 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
6030445D17RikE9Q8F9 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
6030445D17RikE9Q8F9 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.97□□□□□ -0.97
6030445D17RikE9Q8F9 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
6030445D17RikE9Q8F9 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
6030445D17RikE9Q8F9 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.97□□□□□ -0.97
6030445D17RikE9Q8F9 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
6030445D17RikE9Q8F9 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
6030445D17RikE9Q8F9 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
6030445D17RikE9Q8F9 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.97□□□□□ -0.97
6030445D17RikE9Q8F9 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
6030445D17RikE9Q8F9 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC8.97□□□□□ -0.97
6030445D17RikE9Q8F9 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
6030445D17RikE9Q8F9 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
6030445D17RikE9Q8F9 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.97
6030445D17RikE9Q8F9 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.97
6030445D17RikE9Q8F9 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.97
6030445D17RikE9Q8F9 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.97
6030445D17RikE9Q8F9 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.97
6030445D17RikE9Q8F9 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.96□□□□□ -0.97
6030445D17RikE9Q8F9 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.97
6030445D17RikE9Q8F9 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC8.96□□□□□ -0.97
6030445D17RikE9Q8F9 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
6030445D17RikE9Q8F9 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
6030445D17RikE9Q8F9 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC8.96□□□□□ -0.98
6030445D17RikE9Q8F9 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
6030445D17RikE9Q8F9 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
6030445D17RikE9Q8F9 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC8.96□□□□□ -0.98
6030445D17RikE9Q8F9 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC8.96□□□□□ -0.98
6030445D17RikE9Q8F9 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC8.96□□□□□ -0.98
6030445D17RikE9Q8F9 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC8.96□□□□□ -0.98
6030445D17RikE9Q8F9 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC8.96□□□□□ -0.98
6030445D17RikE9Q8F9 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
6030445D17RikE9Q8F9 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC8.96□□□□□ -0.98
6030445D17RikE9Q8F9 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
6030445D17RikE9Q8F9 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
6030445D17RikE9Q8F9 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
6030445D17RikE9Q8F9 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC8.96□□□□□ -0.98
6030445D17RikE9Q8F9 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.96□□□□□ -0.98
6030445D17RikE9Q8F9 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
6030445D17RikE9Q8F9 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
6030445D17RikE9Q8F9 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC8.96□□□□□ -0.98
6030445D17RikE9Q8F9 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
6030445D17RikE9Q8F9 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
6030445D17RikE9Q8F9 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
6030445D17RikE9Q8F9 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
6030445D17RikE9Q8F9 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
6030445D17RikE9Q8F9 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
6030445D17RikE9Q8F9 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
6030445D17RikE9Q8F9 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC8.96□□□□□ -0.98
6030445D17RikE9Q8F9 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
6030445D17RikE9Q8F9 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.96□□□□□ -0.98
6030445D17RikE9Q8F9 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
6030445D17RikE9Q8F9 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
6030445D17RikE9Q8F9 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
6030445D17RikE9Q8F9 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
6030445D17RikE9Q8F9 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
6030445D17RikE9Q8F9 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
6030445D17RikE9Q8F9 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
6030445D17RikE9Q8F9 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
6030445D17RikE9Q8F9 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.8 ms