Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6B2

Ccdc85c, Coiled-coil domain-containing protein 85C, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc85cE9Q6B2 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc85cE9Q6B2 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc85cE9Q6B2 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc85cE9Q6B2 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc85cE9Q6B2 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Ccdc85cE9Q6B2 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Ccdc85cE9Q6B2 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Ccdc85cE9Q6B2 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Ccdc85cE9Q6B2 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Ccdc85cE9Q6B2 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc85cE9Q6B2 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc85cE9Q6B2 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc85cE9Q6B2 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc85cE9Q6B2 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc85cE9Q6B2 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc85cE9Q6B2 Styxl1-205ENSMUST00000111164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc85cE9Q6B2 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc85cE9Q6B2 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc85cE9Q6B2 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc85cE9Q6B2 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc85cE9Q6B2 Gm16505-201ENSMUST00000179981 232 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc85cE9Q6B2 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc85cE9Q6B2 Gm29237-201ENSMUST00000186216 448 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc85cE9Q6B2 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc85cE9Q6B2 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc85cE9Q6B2 AU022133-201ENSMUST00000200601 873 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc85cE9Q6B2 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc85cE9Q6B2 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc85cE9Q6B2 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc85cE9Q6B2 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc85cE9Q6B2 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc85cE9Q6B2 Mybphl-201ENSMUST00000090563 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc85cE9Q6B2 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc85cE9Q6B2 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc85cE9Q6B2 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc85cE9Q6B2 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc85cE9Q6B2 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc85cE9Q6B2 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc85cE9Q6B2 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc85cE9Q6B2 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc85cE9Q6B2 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc85cE9Q6B2 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc85cE9Q6B2 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc85cE9Q6B2 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc85cE9Q6B2 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc85cE9Q6B2 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc85cE9Q6B2 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc85cE9Q6B2 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc85cE9Q6B2 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc85cE9Q6B2 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc85cE9Q6B2 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc85cE9Q6B2 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc85cE9Q6B2 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc85cE9Q6B2 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc85cE9Q6B2 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc85cE9Q6B2 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc85cE9Q6B2 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc85cE9Q6B2 Gm14235-201ENSMUST00000142445 366 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc85cE9Q6B2 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc85cE9Q6B2 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc85cE9Q6B2 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc85cE9Q6B2 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc85cE9Q6B2 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc85cE9Q6B2 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc85cE9Q6B2 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc85cE9Q6B2 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc85cE9Q6B2 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc85cE9Q6B2 Rbm8a2-201ENSMUST00000104983 1338 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc85cE9Q6B2 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc85cE9Q6B2 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc85cE9Q6B2 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc85cE9Q6B2 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc85cE9Q6B2 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc85cE9Q6B2 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc85cE9Q6B2 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc85cE9Q6B2 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc85cE9Q6B2 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc85cE9Q6B2 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc85cE9Q6B2 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc85cE9Q6B2 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc85cE9Q6B2 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc85cE9Q6B2 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc85cE9Q6B2 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc85cE9Q6B2 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc85cE9Q6B2 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc85cE9Q6B2 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc85cE9Q6B2 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc85cE9Q6B2 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc85cE9Q6B2 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc85cE9Q6B2 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc85cE9Q6B2 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc85cE9Q6B2 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc85cE9Q6B2 Gm9333-201ENSMUST00000205452 1323 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc85cE9Q6B2 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc85cE9Q6B2 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc85cE9Q6B2 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc85cE9Q6B2 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc85cE9Q6B2 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc85cE9Q6B2 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc85cE9Q6B2 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms