Protein–RNA interactions for Protein: E9Q4T4

Ccdc71l, Coiled-coil domain-containing 71-like, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc71lE9Q4T4 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Ccdc71lE9Q4T4 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ccdc71lE9Q4T4 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ccdc71lE9Q4T4 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ccdc71lE9Q4T4 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ccdc71lE9Q4T4 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ccdc71lE9Q4T4 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ccdc71lE9Q4T4 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Ccdc71lE9Q4T4 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Ccdc71lE9Q4T4 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ccdc71lE9Q4T4 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ccdc71lE9Q4T4 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ccdc71lE9Q4T4 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ccdc71lE9Q4T4 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ccdc71lE9Q4T4 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ccdc71lE9Q4T4 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ccdc71lE9Q4T4 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ccdc71lE9Q4T4 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ccdc71lE9Q4T4 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ccdc71lE9Q4T4 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Ccdc71lE9Q4T4 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Ccdc71lE9Q4T4 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Ccdc71lE9Q4T4 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Ccdc71lE9Q4T4 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Ccdc71lE9Q4T4 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccdc71lE9Q4T4 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccdc71lE9Q4T4 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccdc71lE9Q4T4 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccdc71lE9Q4T4 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccdc71lE9Q4T4 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccdc71lE9Q4T4 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccdc71lE9Q4T4 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccdc71lE9Q4T4 Pitpnm3-202ENSMUST00000108508 6450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccdc71lE9Q4T4 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccdc71lE9Q4T4 Rgs7bp-201ENSMUST00000063551 7077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccdc71lE9Q4T4 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccdc71lE9Q4T4 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccdc71lE9Q4T4 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccdc71lE9Q4T4 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccdc71lE9Q4T4 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccdc71lE9Q4T4 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccdc71lE9Q4T4 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccdc71lE9Q4T4 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccdc71lE9Q4T4 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccdc71lE9Q4T4 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccdc71lE9Q4T4 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccdc71lE9Q4T4 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccdc71lE9Q4T4 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccdc71lE9Q4T4 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccdc71lE9Q4T4 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccdc71lE9Q4T4 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccdc71lE9Q4T4 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccdc71lE9Q4T4 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccdc71lE9Q4T4 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccdc71lE9Q4T4 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccdc71lE9Q4T4 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccdc71lE9Q4T4 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccdc71lE9Q4T4 Ttc14-201ENSMUST00000099153 9661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccdc71lE9Q4T4 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccdc71lE9Q4T4 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccdc71lE9Q4T4 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccdc71lE9Q4T4 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccdc71lE9Q4T4 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccdc71lE9Q4T4 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccdc71lE9Q4T4 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccdc71lE9Q4T4 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccdc71lE9Q4T4 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccdc71lE9Q4T4 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccdc71lE9Q4T4 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccdc71lE9Q4T4 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccdc71lE9Q4T4 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccdc71lE9Q4T4 Stox2-209ENSMUST00000211882 9696 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccdc71lE9Q4T4 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccdc71lE9Q4T4 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccdc71lE9Q4T4 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccdc71lE9Q4T4 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccdc71lE9Q4T4 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccdc71lE9Q4T4 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccdc71lE9Q4T4 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccdc71lE9Q4T4 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccdc71lE9Q4T4 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccdc71lE9Q4T4 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccdc71lE9Q4T4 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccdc71lE9Q4T4 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccdc71lE9Q4T4 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccdc71lE9Q4T4 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccdc71lE9Q4T4 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccdc71lE9Q4T4 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccdc71lE9Q4T4 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccdc71lE9Q4T4 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccdc71lE9Q4T4 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccdc71lE9Q4T4 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccdc71lE9Q4T4 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccdc71lE9Q4T4 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccdc71lE9Q4T4 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccdc71lE9Q4T4 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccdc71lE9Q4T4 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccdc71lE9Q4T4 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccdc71lE9Q4T4 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccdc71lE9Q4T4 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.1 ms