Protein–RNA interactions for Protein: E9Q3H4

Susd1, Sushi domain-containing 1, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Susd1E9Q3H4 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Susd1E9Q3H4 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Susd1E9Q3H4 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Susd1E9Q3H4 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Susd1E9Q3H4 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Susd1E9Q3H4 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Susd1E9Q3H4 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Susd1E9Q3H4 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Susd1E9Q3H4 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Susd1E9Q3H4 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Susd1E9Q3H4 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Susd1E9Q3H4 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Susd1E9Q3H4 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Susd1E9Q3H4 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Susd1E9Q3H4 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Susd1E9Q3H4 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Susd1E9Q3H4 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Susd1E9Q3H4 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Susd1E9Q3H4 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Susd1E9Q3H4 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Susd1E9Q3H4 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Susd1E9Q3H4 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Susd1E9Q3H4 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Susd1E9Q3H4 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Susd1E9Q3H4 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Susd1E9Q3H4 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Susd1E9Q3H4 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Susd1E9Q3H4 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Susd1E9Q3H4 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Susd1E9Q3H4 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Susd1E9Q3H4 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Susd1E9Q3H4 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Susd1E9Q3H4 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Susd1E9Q3H4 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Susd1E9Q3H4 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Susd1E9Q3H4 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Susd1E9Q3H4 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Susd1E9Q3H4 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Susd1E9Q3H4 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Susd1E9Q3H4 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Susd1E9Q3H4 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Susd1E9Q3H4 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Susd1E9Q3H4 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Susd1E9Q3H4 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Susd1E9Q3H4 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Susd1E9Q3H4 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Susd1E9Q3H4 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Susd1E9Q3H4 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Susd1E9Q3H4 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Susd1E9Q3H4 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Susd1E9Q3H4 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Susd1E9Q3H4 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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Susd1E9Q3H4 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Susd1E9Q3H4 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Susd1E9Q3H4 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
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Susd1E9Q3H4 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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Susd1E9Q3H4 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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Susd1E9Q3H4 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Susd1E9Q3H4 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Susd1E9Q3H4 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Susd1E9Q3H4 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Susd1E9Q3H4 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Susd1E9Q3H4 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Susd1E9Q3H4 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Susd1E9Q3H4 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Susd1E9Q3H4 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Susd1E9Q3H4 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Susd1E9Q3H4 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Susd1E9Q3H4 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Susd1E9Q3H4 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Susd1E9Q3H4 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Susd1E9Q3H4 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Susd1E9Q3H4 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Susd1E9Q3H4 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Susd1E9Q3H4 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Susd1E9Q3H4 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Susd1E9Q3H4 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Susd1E9Q3H4 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Susd1E9Q3H4 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Susd1E9Q3H4 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Susd1E9Q3H4 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Susd1E9Q3H4 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Susd1E9Q3H4 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Susd1E9Q3H4 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Susd1E9Q3H4 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Susd1E9Q3H4 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Susd1E9Q3H4 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Susd1E9Q3H4 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Susd1E9Q3H4 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Susd1E9Q3H4 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Susd1E9Q3H4 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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