Protein–RNA interactions for Protein: E9PZ54

Gcom1, GRINL1A complex locus, mousemouse

Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcom1E9PZ54 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gcom1E9PZ54 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gcom1E9PZ54 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gcom1E9PZ54 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gcom1E9PZ54 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gcom1E9PZ54 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gcom1E9PZ54 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gcom1E9PZ54 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gcom1E9PZ54 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gcom1E9PZ54 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gcom1E9PZ54 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gcom1E9PZ54 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gcom1E9PZ54 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gcom1E9PZ54 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gcom1E9PZ54 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gcom1E9PZ54 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gcom1E9PZ54 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gcom1E9PZ54 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gcom1E9PZ54 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gcom1E9PZ54 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gcom1E9PZ54 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gcom1E9PZ54 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gcom1E9PZ54 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gcom1E9PZ54 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Gcom1E9PZ54 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gcom1E9PZ54 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gcom1E9PZ54 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gcom1E9PZ54 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gcom1E9PZ54 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gcom1E9PZ54 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gcom1E9PZ54 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gcom1E9PZ54 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gcom1E9PZ54 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gcom1E9PZ54 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gcom1E9PZ54 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gcom1E9PZ54 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gcom1E9PZ54 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gcom1E9PZ54 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Gcom1E9PZ54 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gcom1E9PZ54 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gcom1E9PZ54 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gcom1E9PZ54 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gcom1E9PZ54 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gcom1E9PZ54 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gcom1E9PZ54 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gcom1E9PZ54 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gcom1E9PZ54 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
Gcom1E9PZ54 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gcom1E9PZ54 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gcom1E9PZ54 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gcom1E9PZ54 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gcom1E9PZ54 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Gcom1E9PZ54 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gcom1E9PZ54 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gcom1E9PZ54 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gcom1E9PZ54 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gcom1E9PZ54 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gcom1E9PZ54 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gcom1E9PZ54 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gcom1E9PZ54 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gcom1E9PZ54 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Gcom1E9PZ54 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Gcom1E9PZ54 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Gcom1E9PZ54 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Gcom1E9PZ54 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Gcom1E9PZ54 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Gcom1E9PZ54 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Gcom1E9PZ54 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Gcom1E9PZ54 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Gcom1E9PZ54 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Gcom1E9PZ54 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Gcom1E9PZ54 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Gcom1E9PZ54 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Gcom1E9PZ54 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Gcom1E9PZ54 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Gcom1E9PZ54 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gcom1E9PZ54 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gcom1E9PZ54 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gcom1E9PZ54 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gcom1E9PZ54 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Gcom1E9PZ54 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gcom1E9PZ54 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gcom1E9PZ54 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gcom1E9PZ54 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gcom1E9PZ54 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gcom1E9PZ54 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gcom1E9PZ54 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gcom1E9PZ54 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Gcom1E9PZ54 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gcom1E9PZ54 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gcom1E9PZ54 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gcom1E9PZ54 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gcom1E9PZ54 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gcom1E9PZ54 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gcom1E9PZ54 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gcom1E9PZ54 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gcom1E9PZ54 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gcom1E9PZ54 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gcom1E9PZ54 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gcom1E9PZ54 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms