Protein–RNA interactions for Protein: E9PUU5

Zfp839, Zinc finger protein 839, mousemouse

Predictions only

Length 921 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp839E9PUU5 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Zfp839E9PUU5 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Zfp839E9PUU5 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Zfp839E9PUU5 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Zfp839E9PUU5 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Zfp839E9PUU5 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Zfp839E9PUU5 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Zfp839E9PUU5 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Zfp839E9PUU5 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Zfp839E9PUU5 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Zfp839E9PUU5 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Zfp839E9PUU5 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Zfp839E9PUU5 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Zfp839E9PUU5 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Zfp839E9PUU5 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Zfp839E9PUU5 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Zfp839E9PUU5 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Zfp839E9PUU5 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Zfp839E9PUU5 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Zfp839E9PUU5 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Zfp839E9PUU5 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Zfp839E9PUU5 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Zfp839E9PUU5 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Zfp839E9PUU5 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Zfp839E9PUU5 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Zfp839E9PUU5 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Zfp839E9PUU5 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Zfp839E9PUU5 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Zfp839E9PUU5 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Zfp839E9PUU5 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Zfp839E9PUU5 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Zfp839E9PUU5 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Zfp839E9PUU5 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Zfp839E9PUU5 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Zfp839E9PUU5 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Zfp839E9PUU5 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Zfp839E9PUU5 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Zfp839E9PUU5 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Zfp839E9PUU5 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Zfp839E9PUU5 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Zfp839E9PUU5 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Zfp839E9PUU5 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Zfp839E9PUU5 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Zfp839E9PUU5 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Zfp839E9PUU5 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Zfp839E9PUU5 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Zfp839E9PUU5 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Zfp839E9PUU5 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Zfp839E9PUU5 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Zfp839E9PUU5 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Zfp839E9PUU5 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Zfp839E9PUU5 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Zfp839E9PUU5 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Zfp839E9PUU5 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Zfp839E9PUU5 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Zfp839E9PUU5 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Zfp839E9PUU5 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Zfp839E9PUU5 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Zfp839E9PUU5 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Zfp839E9PUU5 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Zfp839E9PUU5 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Zfp839E9PUU5 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Zfp839E9PUU5 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Zfp839E9PUU5 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Zfp839E9PUU5 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Zfp839E9PUU5 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Zfp839E9PUU5 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Zfp839E9PUU5 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Zfp839E9PUU5 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Zfp839E9PUU5 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Zfp839E9PUU5 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Zfp839E9PUU5 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Zfp839E9PUU5 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Zfp839E9PUU5 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Zfp839E9PUU5 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Zfp839E9PUU5 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Zfp839E9PUU5 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Zfp839E9PUU5 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Zfp839E9PUU5 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zfp839E9PUU5 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zfp839E9PUU5 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zfp839E9PUU5 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zfp839E9PUU5 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zfp839E9PUU5 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zfp839E9PUU5 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zfp839E9PUU5 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zfp839E9PUU5 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zfp839E9PUU5 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Zfp839E9PUU5 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zfp839E9PUU5 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zfp839E9PUU5 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zfp839E9PUU5 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zfp839E9PUU5 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Zfp839E9PUU5 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zfp839E9PUU5 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Zfp839E9PUU5 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Zfp839E9PUU5 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Zfp839E9PUU5 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zfp839E9PUU5 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Zfp839E9PUU5 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms