Protein–RNA interactions for Protein: D3Z3K2

Ccnb1ip1, E3 ubiquitin-protein ligase CCNB1IP1, mousemouse

Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccnb1ip1D3Z3K2 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccnb1ip1D3Z3K2 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccnb1ip1D3Z3K2 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccnb1ip1D3Z3K2 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccnb1ip1D3Z3K2 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccnb1ip1D3Z3K2 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccnb1ip1D3Z3K2 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccnb1ip1D3Z3K2 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccnb1ip1D3Z3K2 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccnb1ip1D3Z3K2 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccnb1ip1D3Z3K2 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccnb1ip1D3Z3K2 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccnb1ip1D3Z3K2 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccnb1ip1D3Z3K2 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccnb1ip1D3Z3K2 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccnb1ip1D3Z3K2 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccnb1ip1D3Z3K2 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccnb1ip1D3Z3K2 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccnb1ip1D3Z3K2 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccnb1ip1D3Z3K2 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccnb1ip1D3Z3K2 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccnb1ip1D3Z3K2 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccnb1ip1D3Z3K2 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccnb1ip1D3Z3K2 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccnb1ip1D3Z3K2 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccnb1ip1D3Z3K2 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccnb1ip1D3Z3K2 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccnb1ip1D3Z3K2 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccnb1ip1D3Z3K2 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccnb1ip1D3Z3K2 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccnb1ip1D3Z3K2 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccnb1ip1D3Z3K2 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccnb1ip1D3Z3K2 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccnb1ip1D3Z3K2 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccnb1ip1D3Z3K2 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccnb1ip1D3Z3K2 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccnb1ip1D3Z3K2 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccnb1ip1D3Z3K2 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccnb1ip1D3Z3K2 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccnb1ip1D3Z3K2 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccnb1ip1D3Z3K2 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccnb1ip1D3Z3K2 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccnb1ip1D3Z3K2 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccnb1ip1D3Z3K2 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccnb1ip1D3Z3K2 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccnb1ip1D3Z3K2 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccnb1ip1D3Z3K2 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccnb1ip1D3Z3K2 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccnb1ip1D3Z3K2 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccnb1ip1D3Z3K2 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccnb1ip1D3Z3K2 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccnb1ip1D3Z3K2 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccnb1ip1D3Z3K2 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccnb1ip1D3Z3K2 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccnb1ip1D3Z3K2 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccnb1ip1D3Z3K2 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccnb1ip1D3Z3K2 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccnb1ip1D3Z3K2 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccnb1ip1D3Z3K2 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccnb1ip1D3Z3K2 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccnb1ip1D3Z3K2 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccnb1ip1D3Z3K2 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccnb1ip1D3Z3K2 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccnb1ip1D3Z3K2 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccnb1ip1D3Z3K2 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccnb1ip1D3Z3K2 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccnb1ip1D3Z3K2 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccnb1ip1D3Z3K2 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccnb1ip1D3Z3K2 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccnb1ip1D3Z3K2 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms