Protein–RNA interactions for Protein: B4XVQ1

Phf11b, PHD finger protein 11B, mousemouse

Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf11bB4XVQ1 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Phf11bB4XVQ1 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Phf11bB4XVQ1 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Phf11bB4XVQ1 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Phf11bB4XVQ1 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Phf11bB4XVQ1 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Phf11bB4XVQ1 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Phf11bB4XVQ1 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Phf11bB4XVQ1 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Phf11bB4XVQ1 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Phf11bB4XVQ1 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Phf11bB4XVQ1 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Phf11bB4XVQ1 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Phf11bB4XVQ1 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Phf11bB4XVQ1 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Phf11bB4XVQ1 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Phf11bB4XVQ1 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Phf11bB4XVQ1 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Phf11bB4XVQ1 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Phf11bB4XVQ1 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Phf11bB4XVQ1 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Phf11bB4XVQ1 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Phf11bB4XVQ1 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Phf11bB4XVQ1 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Phf11bB4XVQ1 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Phf11bB4XVQ1 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Phf11bB4XVQ1 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Phf11bB4XVQ1 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Phf11bB4XVQ1 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Phf11bB4XVQ1 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Phf11bB4XVQ1 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Phf11bB4XVQ1 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Phf11bB4XVQ1 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Phf11bB4XVQ1 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Phf11bB4XVQ1 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Phf11bB4XVQ1 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Phf11bB4XVQ1 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Phf11bB4XVQ1 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Phf11bB4XVQ1 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Phf11bB4XVQ1 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Phf11bB4XVQ1 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Phf11bB4XVQ1 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Phf11bB4XVQ1 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Phf11bB4XVQ1 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Phf11bB4XVQ1 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Phf11bB4XVQ1 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Phf11bB4XVQ1 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Phf11bB4XVQ1 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Phf11bB4XVQ1 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Phf11bB4XVQ1 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Phf11bB4XVQ1 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Phf11bB4XVQ1 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Phf11bB4XVQ1 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Phf11bB4XVQ1 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Phf11bB4XVQ1 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Phf11bB4XVQ1 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Phf11bB4XVQ1 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Phf11bB4XVQ1 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Phf11bB4XVQ1 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Phf11bB4XVQ1 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Phf11bB4XVQ1 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Phf11bB4XVQ1 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Phf11bB4XVQ1 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Phf11bB4XVQ1 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Phf11bB4XVQ1 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Phf11bB4XVQ1 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Phf11bB4XVQ1 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Phf11bB4XVQ1 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Phf11bB4XVQ1 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Phf11bB4XVQ1 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Phf11bB4XVQ1 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Phf11bB4XVQ1 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Phf11bB4XVQ1 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Phf11bB4XVQ1 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Phf11bB4XVQ1 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Phf11bB4XVQ1 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Phf11bB4XVQ1 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Phf11bB4XVQ1 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Phf11bB4XVQ1 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Phf11bB4XVQ1 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Phf11bB4XVQ1 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Phf11bB4XVQ1 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Phf11bB4XVQ1 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Phf11bB4XVQ1 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Phf11bB4XVQ1 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Phf11bB4XVQ1 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Phf11bB4XVQ1 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Phf11bB4XVQ1 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Phf11bB4XVQ1 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Phf11bB4XVQ1 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Phf11bB4XVQ1 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Phf11bB4XVQ1 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Phf11bB4XVQ1 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Phf11bB4XVQ1 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Phf11bB4XVQ1 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Phf11bB4XVQ1 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Phf11bB4XVQ1 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Phf11bB4XVQ1 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Phf11bB4XVQ1 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Phf11bB4XVQ1 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms