Protein–RNA interactions for Protein: B2RXA7

Cyp26c1, Cytochrome P450, family 26, subfamily c, polypeptide 1, mousemouse

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp26c1B2RXA7 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cyp26c1B2RXA7 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cyp26c1B2RXA7 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cyp26c1B2RXA7 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cyp26c1B2RXA7 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cyp26c1B2RXA7 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cyp26c1B2RXA7 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cyp26c1B2RXA7 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cyp26c1B2RXA7 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cyp26c1B2RXA7 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cyp26c1B2RXA7 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cyp26c1B2RXA7 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cyp26c1B2RXA7 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cyp26c1B2RXA7 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cyp26c1B2RXA7 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cyp26c1B2RXA7 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cyp26c1B2RXA7 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cyp26c1B2RXA7 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cyp26c1B2RXA7 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cyp26c1B2RXA7 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cyp26c1B2RXA7 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cyp26c1B2RXA7 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cyp26c1B2RXA7 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cyp26c1B2RXA7 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cyp26c1B2RXA7 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cyp26c1B2RXA7 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cyp26c1B2RXA7 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cyp26c1B2RXA7 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cyp26c1B2RXA7 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cyp26c1B2RXA7 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Cyp26c1B2RXA7 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Cyp26c1B2RXA7 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cyp26c1B2RXA7 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cyp26c1B2RXA7 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Cyp26c1B2RXA7 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cyp26c1B2RXA7 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cyp26c1B2RXA7 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cyp26c1B2RXA7 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cyp26c1B2RXA7 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cyp26c1B2RXA7 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cyp26c1B2RXA7 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cyp26c1B2RXA7 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cyp26c1B2RXA7 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cyp26c1B2RXA7 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cyp26c1B2RXA7 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cyp26c1B2RXA7 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cyp26c1B2RXA7 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cyp26c1B2RXA7 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cyp26c1B2RXA7 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cyp26c1B2RXA7 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cyp26c1B2RXA7 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cyp26c1B2RXA7 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cyp26c1B2RXA7 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cyp26c1B2RXA7 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Cyp26c1B2RXA7 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cyp26c1B2RXA7 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cyp26c1B2RXA7 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cyp26c1B2RXA7 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cyp26c1B2RXA7 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cyp26c1B2RXA7 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cyp26c1B2RXA7 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cyp26c1B2RXA7 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cyp26c1B2RXA7 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cyp26c1B2RXA7 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Cyp26c1B2RXA7 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cyp26c1B2RXA7 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Cyp26c1B2RXA7 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cyp26c1B2RXA7 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cyp26c1B2RXA7 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cyp26c1B2RXA7 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cyp26c1B2RXA7 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cyp26c1B2RXA7 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Cyp26c1B2RXA7 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Cyp26c1B2RXA7 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Cyp26c1B2RXA7 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cyp26c1B2RXA7 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cyp26c1B2RXA7 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cyp26c1B2RXA7 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cyp26c1B2RXA7 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cyp26c1B2RXA7 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cyp26c1B2RXA7 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cyp26c1B2RXA7 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cyp26c1B2RXA7 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cyp26c1B2RXA7 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cyp26c1B2RXA7 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cyp26c1B2RXA7 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cyp26c1B2RXA7 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cyp26c1B2RXA7 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cyp26c1B2RXA7 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cyp26c1B2RXA7 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cyp26c1B2RXA7 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cyp26c1B2RXA7 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cyp26c1B2RXA7 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cyp26c1B2RXA7 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cyp26c1B2RXA7 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cyp26c1B2RXA7 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cyp26c1B2RXA7 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cyp26c1B2RXA7 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cyp26c1B2RXA7 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Cyp26c1B2RXA7 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms