Protein–RNA interactions for Protein: B2RW38

Cfap58, Cilia- and flagella-associated protein 58, mousemouse

Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap58B2RW38 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cfap58B2RW38 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cfap58B2RW38 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cfap58B2RW38 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cfap58B2RW38 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cfap58B2RW38 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cfap58B2RW38 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cfap58B2RW38 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cfap58B2RW38 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cfap58B2RW38 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cfap58B2RW38 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cfap58B2RW38 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cfap58B2RW38 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cfap58B2RW38 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cfap58B2RW38 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cfap58B2RW38 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cfap58B2RW38 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cfap58B2RW38 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cfap58B2RW38 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cfap58B2RW38 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Cfap58B2RW38 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cfap58B2RW38 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Cfap58B2RW38 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cfap58B2RW38 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cfap58B2RW38 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cfap58B2RW38 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cfap58B2RW38 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cfap58B2RW38 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cfap58B2RW38 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cfap58B2RW38 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cfap58B2RW38 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cfap58B2RW38 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cfap58B2RW38 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cfap58B2RW38 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cfap58B2RW38 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cfap58B2RW38 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cfap58B2RW38 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cfap58B2RW38 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cfap58B2RW38 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cfap58B2RW38 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cfap58B2RW38 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cfap58B2RW38 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cfap58B2RW38 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cfap58B2RW38 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cfap58B2RW38 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cfap58B2RW38 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cfap58B2RW38 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cfap58B2RW38 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cfap58B2RW38 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Cfap58B2RW38 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cfap58B2RW38 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cfap58B2RW38 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cfap58B2RW38 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cfap58B2RW38 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cfap58B2RW38 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cfap58B2RW38 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cfap58B2RW38 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cfap58B2RW38 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cfap58B2RW38 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cfap58B2RW38 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cfap58B2RW38 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Cfap58B2RW38 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cfap58B2RW38 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cfap58B2RW38 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cfap58B2RW38 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cfap58B2RW38 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cfap58B2RW38 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cfap58B2RW38 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cfap58B2RW38 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cfap58B2RW38 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cfap58B2RW38 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cfap58B2RW38 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Cfap58B2RW38 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Cfap58B2RW38 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cfap58B2RW38 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cfap58B2RW38 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cfap58B2RW38 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cfap58B2RW38 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cfap58B2RW38 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cfap58B2RW38 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cfap58B2RW38 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cfap58B2RW38 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cfap58B2RW38 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cfap58B2RW38 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cfap58B2RW38 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cfap58B2RW38 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cfap58B2RW38 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cfap58B2RW38 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cfap58B2RW38 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cfap58B2RW38 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cfap58B2RW38 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cfap58B2RW38 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cfap58B2RW38 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cfap58B2RW38 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cfap58B2RW38 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cfap58B2RW38 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cfap58B2RW38 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cfap58B2RW38 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cfap58B2RW38 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cfap58B2RW38 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.7 ms