Protein–RNA interactions for Protein: B2RRD7

Brpf1, Peregrin, mousemouse

Predictions only

Length 1,212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brpf1B2RRD7 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Brpf1B2RRD7 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Brpf1B2RRD7 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Brpf1B2RRD7 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Brpf1B2RRD7 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Brpf1B2RRD7 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Brpf1B2RRD7 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Brpf1B2RRD7 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Brpf1B2RRD7 Mkl2-203ENSMUST00000115809 667 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Brpf1B2RRD7 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Brpf1B2RRD7 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Brpf1B2RRD7 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Brpf1B2RRD7 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Brpf1B2RRD7 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Brpf1B2RRD7 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Brpf1B2RRD7 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Brpf1B2RRD7 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Brpf1B2RRD7 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Brpf1B2RRD7 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Brpf1B2RRD7 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Brpf1B2RRD7 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Brpf1B2RRD7 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Brpf1B2RRD7 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Brpf1B2RRD7 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Brpf1B2RRD7 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Brpf1B2RRD7 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Brpf1B2RRD7 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Brpf1B2RRD7 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Brpf1B2RRD7 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Brpf1B2RRD7 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Brpf1B2RRD7 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Brpf1B2RRD7 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Brpf1B2RRD7 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Brpf1B2RRD7 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Brpf1B2RRD7 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Brpf1B2RRD7 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Brpf1B2RRD7 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Brpf1B2RRD7 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Brpf1B2RRD7 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Brpf1B2RRD7 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Brpf1B2RRD7 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Brpf1B2RRD7 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Brpf1B2RRD7 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Brpf1B2RRD7 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Brpf1B2RRD7 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Brpf1B2RRD7 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Brpf1B2RRD7 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Brpf1B2RRD7 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Brpf1B2RRD7 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Brpf1B2RRD7 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Brpf1B2RRD7 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Brpf1B2RRD7 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Brpf1B2RRD7 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Brpf1B2RRD7 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Brpf1B2RRD7 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Brpf1B2RRD7 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Brpf1B2RRD7 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Brpf1B2RRD7 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Brpf1B2RRD7 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Brpf1B2RRD7 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Brpf1B2RRD7 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Brpf1B2RRD7 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Brpf1B2RRD7 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Brpf1B2RRD7 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Brpf1B2RRD7 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Brpf1B2RRD7 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Brpf1B2RRD7 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Brpf1B2RRD7 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Brpf1B2RRD7 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Brpf1B2RRD7 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Brpf1B2RRD7 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Brpf1B2RRD7 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Brpf1B2RRD7 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Brpf1B2RRD7 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Brpf1B2RRD7 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Brpf1B2RRD7 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Brpf1B2RRD7 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Brpf1B2RRD7 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Brpf1B2RRD7 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Brpf1B2RRD7 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Brpf1B2RRD7 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Brpf1B2RRD7 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Brpf1B2RRD7 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Brpf1B2RRD7 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Brpf1B2RRD7 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Brpf1B2RRD7 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Brpf1B2RRD7 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Brpf1B2RRD7 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Brpf1B2RRD7 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Brpf1B2RRD7 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Brpf1B2RRD7 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Brpf1B2RRD7 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Brpf1B2RRD7 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Brpf1B2RRD7 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Brpf1B2RRD7 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Brpf1B2RRD7 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Brpf1B2RRD7 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Brpf1B2RRD7 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Brpf1B2RRD7 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Brpf1B2RRD7 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms