Protein–RNA interactions for Protein: B1AVU6

Gm436, Predicted gene 436, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm436B1AVU6 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm436B1AVU6 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm436B1AVU6 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm436B1AVU6 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm436B1AVU6 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm436B1AVU6 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm436B1AVU6 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm436B1AVU6 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm436B1AVU6 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm436B1AVU6 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm436B1AVU6 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm436B1AVU6 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm436B1AVU6 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm436B1AVU6 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm436B1AVU6 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm436B1AVU6 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm436B1AVU6 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm436B1AVU6 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm436B1AVU6 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm436B1AVU6 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm436B1AVU6 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm436B1AVU6 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm436B1AVU6 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm436B1AVU6 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm436B1AVU6 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm436B1AVU6 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm436B1AVU6 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm436B1AVU6 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm436B1AVU6 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm436B1AVU6 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm436B1AVU6 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm436B1AVU6 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm436B1AVU6 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm436B1AVU6 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm436B1AVU6 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm436B1AVU6 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm436B1AVU6 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm436B1AVU6 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm436B1AVU6 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm436B1AVU6 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm436B1AVU6 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm436B1AVU6 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm436B1AVU6 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm436B1AVU6 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm436B1AVU6 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm436B1AVU6 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm436B1AVU6 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm436B1AVU6 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm436B1AVU6 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm436B1AVU6 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm436B1AVU6 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm436B1AVU6 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm436B1AVU6 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm436B1AVU6 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm436B1AVU6 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm436B1AVU6 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm436B1AVU6 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm436B1AVU6 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm436B1AVU6 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm436B1AVU6 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm436B1AVU6 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm436B1AVU6 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm436B1AVU6 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm436B1AVU6 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm436B1AVU6 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm436B1AVU6 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm436B1AVU6 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm436B1AVU6 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm436B1AVU6 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm436B1AVU6 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm436B1AVU6 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm436B1AVU6 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm436B1AVU6 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm436B1AVU6 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm436B1AVU6 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm436B1AVU6 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm436B1AVU6 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm436B1AVU6 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm436B1AVU6 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm436B1AVU6 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm436B1AVU6 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm436B1AVU6 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm436B1AVU6 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm436B1AVU6 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm436B1AVU6 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm436B1AVU6 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm436B1AVU6 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm436B1AVU6 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm436B1AVU6 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm436B1AVU6 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm436B1AVU6 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm436B1AVU6 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm436B1AVU6 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm436B1AVU6 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm436B1AVU6 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm436B1AVU6 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm436B1AVU6 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm436B1AVU6 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm436B1AVU6 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm436B1AVU6 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
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