Protein–RNA interactions for Protein: B1AS29

Grik3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik3B1AS29 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Grik3B1AS29 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Grik3B1AS29 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Grik3B1AS29 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Grik3B1AS29 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Grik3B1AS29 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Grik3B1AS29 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Grik3B1AS29 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Grik3B1AS29 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Grik3B1AS29 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Grik3B1AS29 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Grik3B1AS29 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Grik3B1AS29 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Grik3B1AS29 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Grik3B1AS29 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Grik3B1AS29 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Grik3B1AS29 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Grik3B1AS29 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Grik3B1AS29 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Grik3B1AS29 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Grik3B1AS29 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Grik3B1AS29 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Grik3B1AS29 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Grik3B1AS29 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Grik3B1AS29 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Grik3B1AS29 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Grik3B1AS29 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Grik3B1AS29 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Grik3B1AS29 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Grik3B1AS29 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Grik3B1AS29 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Grik3B1AS29 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Grik3B1AS29 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Grik3B1AS29 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Grik3B1AS29 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Grik3B1AS29 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Grik3B1AS29 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Grik3B1AS29 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Grik3B1AS29 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Grik3B1AS29 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Grik3B1AS29 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Grik3B1AS29 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Grik3B1AS29 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Grik3B1AS29 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Grik3B1AS29 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Grik3B1AS29 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Grik3B1AS29 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Grik3B1AS29 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Grik3B1AS29 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Grik3B1AS29 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Grik3B1AS29 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Grik3B1AS29 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Grik3B1AS29 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Grik3B1AS29 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Grik3B1AS29 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Grik3B1AS29 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Grik3B1AS29 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Grik3B1AS29 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Grik3B1AS29 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Grik3B1AS29 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Grik3B1AS29 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Grik3B1AS29 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Grik3B1AS29 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Grik3B1AS29 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Grik3B1AS29 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Grik3B1AS29 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Grik3B1AS29 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Grik3B1AS29 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Grik3B1AS29 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Grik3B1AS29 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Grik3B1AS29 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Grik3B1AS29 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Grik3B1AS29 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Grik3B1AS29 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Grik3B1AS29 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Grik3B1AS29 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Grik3B1AS29 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Grik3B1AS29 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Grik3B1AS29 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Grik3B1AS29 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Grik3B1AS29 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Grik3B1AS29 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Grik3B1AS29 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Grik3B1AS29 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Grik3B1AS29 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Grik3B1AS29 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Grik3B1AS29 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Grik3B1AS29 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Grik3B1AS29 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Grik3B1AS29 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Grik3B1AS29 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Grik3B1AS29 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Grik3B1AS29 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Grik3B1AS29 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Grik3B1AS29 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Grik3B1AS29 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Grik3B1AS29 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Grik3B1AS29 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Grik3B1AS29 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Grik3B1AS29 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms