Protein–RNA interactions for Protein: A2BFR3

H2al1j, Histone H2A, mousemouse

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Length 109 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2al1jA2BFR3 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
H2al1jA2BFR3 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
H2al1jA2BFR3 Dlg4-203ENSMUST00000108588 3457 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
H2al1jA2BFR3 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
H2al1jA2BFR3 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
H2al1jA2BFR3 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
H2al1jA2BFR3 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
H2al1jA2BFR3 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
H2al1jA2BFR3 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
H2al1jA2BFR3 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
H2al1jA2BFR3 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
H2al1jA2BFR3 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
H2al1jA2BFR3 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
H2al1jA2BFR3 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
H2al1jA2BFR3 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
H2al1jA2BFR3 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
H2al1jA2BFR3 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
H2al1jA2BFR3 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
H2al1jA2BFR3 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
H2al1jA2BFR3 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
H2al1jA2BFR3 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
H2al1jA2BFR3 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
H2al1jA2BFR3 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
H2al1jA2BFR3 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
H2al1jA2BFR3 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
H2al1jA2BFR3 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
H2al1jA2BFR3 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
H2al1jA2BFR3 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
H2al1jA2BFR3 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
H2al1jA2BFR3 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
H2al1jA2BFR3 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
H2al1jA2BFR3 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
H2al1jA2BFR3 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
H2al1jA2BFR3 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
H2al1jA2BFR3 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
H2al1jA2BFR3 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
H2al1jA2BFR3 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
H2al1jA2BFR3 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
H2al1jA2BFR3 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
H2al1jA2BFR3 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
H2al1jA2BFR3 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
H2al1jA2BFR3 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
H2al1jA2BFR3 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
H2al1jA2BFR3 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
H2al1jA2BFR3 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
H2al1jA2BFR3 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
H2al1jA2BFR3 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
H2al1jA2BFR3 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
H2al1jA2BFR3 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
H2al1jA2BFR3 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
H2al1jA2BFR3 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
H2al1jA2BFR3 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
H2al1jA2BFR3 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
H2al1jA2BFR3 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
H2al1jA2BFR3 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
H2al1jA2BFR3 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
H2al1jA2BFR3 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
H2al1jA2BFR3 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC11.27□□□□□ -0.6
H2al1jA2BFR3 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
H2al1jA2BFR3 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
H2al1jA2BFR3 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
H2al1jA2BFR3 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
H2al1jA2BFR3 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
H2al1jA2BFR3 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
H2al1jA2BFR3 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
H2al1jA2BFR3 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
H2al1jA2BFR3 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
H2al1jA2BFR3 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
H2al1jA2BFR3 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
H2al1jA2BFR3 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
H2al1jA2BFR3 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
H2al1jA2BFR3 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
H2al1jA2BFR3 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
H2al1jA2BFR3 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
H2al1jA2BFR3 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
H2al1jA2BFR3 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
H2al1jA2BFR3 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
H2al1jA2BFR3 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
H2al1jA2BFR3 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
H2al1jA2BFR3 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
H2al1jA2BFR3 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
H2al1jA2BFR3 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
H2al1jA2BFR3 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
H2al1jA2BFR3 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
H2al1jA2BFR3 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
H2al1jA2BFR3 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
H2al1jA2BFR3 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
H2al1jA2BFR3 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
H2al1jA2BFR3 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
H2al1jA2BFR3 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
H2al1jA2BFR3 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
H2al1jA2BFR3 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
H2al1jA2BFR3 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
H2al1jA2BFR3 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
H2al1jA2BFR3 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
H2al1jA2BFR3 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
H2al1jA2BFR3 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
H2al1jA2BFR3 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
H2al1jA2BFR3 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
H2al1jA2BFR3 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
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