Protein–RNA interactions for Protein: A2AFR3

Frmpd4, FERM and PDZ domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frmpd4A2AFR3 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Frmpd4A2AFR3 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Frmpd4A2AFR3 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Frmpd4A2AFR3 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Frmpd4A2AFR3 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Frmpd4A2AFR3 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Frmpd4A2AFR3 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Frmpd4A2AFR3 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Frmpd4A2AFR3 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Frmpd4A2AFR3 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Frmpd4A2AFR3 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Frmpd4A2AFR3 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Frmpd4A2AFR3 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Frmpd4A2AFR3 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Frmpd4A2AFR3 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Frmpd4A2AFR3 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Frmpd4A2AFR3 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Frmpd4A2AFR3 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Frmpd4A2AFR3 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Frmpd4A2AFR3 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Frmpd4A2AFR3 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Frmpd4A2AFR3 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Frmpd4A2AFR3 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Frmpd4A2AFR3 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Frmpd4A2AFR3 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Frmpd4A2AFR3 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Frmpd4A2AFR3 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Frmpd4A2AFR3 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Frmpd4A2AFR3 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Frmpd4A2AFR3 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Frmpd4A2AFR3 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Frmpd4A2AFR3 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Frmpd4A2AFR3 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Frmpd4A2AFR3 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Frmpd4A2AFR3 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Frmpd4A2AFR3 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Frmpd4A2AFR3 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Frmpd4A2AFR3 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Frmpd4A2AFR3 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Frmpd4A2AFR3 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Frmpd4A2AFR3 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Frmpd4A2AFR3 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Frmpd4A2AFR3 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Frmpd4A2AFR3 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Frmpd4A2AFR3 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Frmpd4A2AFR3 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Frmpd4A2AFR3 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Frmpd4A2AFR3 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Frmpd4A2AFR3 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Frmpd4A2AFR3 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Frmpd4A2AFR3 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Frmpd4A2AFR3 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Frmpd4A2AFR3 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Frmpd4A2AFR3 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Frmpd4A2AFR3 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Frmpd4A2AFR3 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Frmpd4A2AFR3 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Frmpd4A2AFR3 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Frmpd4A2AFR3 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Frmpd4A2AFR3 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Frmpd4A2AFR3 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Frmpd4A2AFR3 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Frmpd4A2AFR3 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Frmpd4A2AFR3 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Frmpd4A2AFR3 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Frmpd4A2AFR3 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Frmpd4A2AFR3 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Frmpd4A2AFR3 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Frmpd4A2AFR3 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Frmpd4A2AFR3 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Frmpd4A2AFR3 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Frmpd4A2AFR3 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Frmpd4A2AFR3 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Frmpd4A2AFR3 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Frmpd4A2AFR3 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Frmpd4A2AFR3 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Frmpd4A2AFR3 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Frmpd4A2AFR3 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Frmpd4A2AFR3 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Frmpd4A2AFR3 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Frmpd4A2AFR3 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Frmpd4A2AFR3 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Frmpd4A2AFR3 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Frmpd4A2AFR3 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Frmpd4A2AFR3 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Frmpd4A2AFR3 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Frmpd4A2AFR3 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Frmpd4A2AFR3 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Frmpd4A2AFR3 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Frmpd4A2AFR3 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Frmpd4A2AFR3 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Frmpd4A2AFR3 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Frmpd4A2AFR3 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Frmpd4A2AFR3 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Frmpd4A2AFR3 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Frmpd4A2AFR3 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Frmpd4A2AFR3 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Frmpd4A2AFR3 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Frmpd4A2AFR3 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Frmpd4A2AFR3 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 107.2 ms