Protein–RNA interactions for Protein: A2A4P4

Gm27029, Predicted gene, 27029, mousemouse

Predictions only

Length 543 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm27029A2A4P4 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm27029A2A4P4 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm27029A2A4P4 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm27029A2A4P4 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm27029A2A4P4 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm27029A2A4P4 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm27029A2A4P4 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm27029A2A4P4 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm27029A2A4P4 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm27029A2A4P4 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm27029A2A4P4 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm27029A2A4P4 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm27029A2A4P4 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm27029A2A4P4 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm27029A2A4P4 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm27029A2A4P4 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm27029A2A4P4 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm27029A2A4P4 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm27029A2A4P4 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm27029A2A4P4 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm27029A2A4P4 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm27029A2A4P4 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm27029A2A4P4 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm27029A2A4P4 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm27029A2A4P4 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm27029A2A4P4 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm27029A2A4P4 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm27029A2A4P4 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm27029A2A4P4 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm27029A2A4P4 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm27029A2A4P4 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm27029A2A4P4 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm27029A2A4P4 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm27029A2A4P4 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm27029A2A4P4 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm27029A2A4P4 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm27029A2A4P4 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm27029A2A4P4 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm27029A2A4P4 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm27029A2A4P4 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm27029A2A4P4 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm27029A2A4P4 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm27029A2A4P4 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm27029A2A4P4 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm27029A2A4P4 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm27029A2A4P4 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm27029A2A4P4 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm27029A2A4P4 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm27029A2A4P4 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm27029A2A4P4 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm27029A2A4P4 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm27029A2A4P4 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm27029A2A4P4 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm27029A2A4P4 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm27029A2A4P4 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm27029A2A4P4 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm27029A2A4P4 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm27029A2A4P4 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm27029A2A4P4 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm27029A2A4P4 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm27029A2A4P4 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm27029A2A4P4 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm27029A2A4P4 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm27029A2A4P4 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm27029A2A4P4 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm27029A2A4P4 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm27029A2A4P4 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm27029A2A4P4 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm27029A2A4P4 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm27029A2A4P4 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm27029A2A4P4 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm27029A2A4P4 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm27029A2A4P4 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm27029A2A4P4 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm27029A2A4P4 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm27029A2A4P4 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm27029A2A4P4 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm27029A2A4P4 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm27029A2A4P4 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm27029A2A4P4 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm27029A2A4P4 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm27029A2A4P4 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm27029A2A4P4 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm27029A2A4P4 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm27029A2A4P4 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm27029A2A4P4 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm27029A2A4P4 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm27029A2A4P4 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm27029A2A4P4 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm27029A2A4P4 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm27029A2A4P4 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm27029A2A4P4 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm27029A2A4P4 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm27029A2A4P4 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm27029A2A4P4 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm27029A2A4P4 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm27029A2A4P4 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm27029A2A4P4 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm27029A2A4P4 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm27029A2A4P4 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.8 ms