Protein–RNA interactions for Protein: A0A0N4SVR5

Rasgef1a, RasGEF domain family, member 1A, mousemouse

Predictions only

Length 498 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rasgef1aA0A0N4SVR5 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rasgef1aA0A0N4SVR5 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rasgef1aA0A0N4SVR5 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rasgef1aA0A0N4SVR5 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rasgef1aA0A0N4SVR5 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rasgef1aA0A0N4SVR5 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Rasgef1aA0A0N4SVR5 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.5 ms